近年来，畜禽水产中违规使用抗生素、禁用化合物及兽药残留超标问题时有发生，为保障畜禽水产品质量安全，维护群众身体健康，国务院食品安全办、工业和信息化部、农业部、国家卫生计生委、食品药品监管总局决定自2016年8月—2017年12月，在全国范围内集中开展畜禽水产品抗生素、禁用化合物及兽药残留超标专项整治行动。对于孔雀石绿等具有抗生素功能的禁用化合物需实名购买。
严打产销禁用兽药行为
专项整治行动中，整顿规范兽用化学药品生产经营主体，摸清兽用抗生素生产经营情况，严厉打击生产、销售硝基呋喃等禁用兽药的行为，对于孔雀石绿等具有抗生素功能的禁用化合物，要建立实名购买和流向登记制度，实施严格管控。
在整治规范兽药使用行为方面，严格管控抗菌药类药物饲料添加剂；严厉打击超剂量超范围用药、违规使用原料药、不执行休药期、不按兽用处方药规定使用处方药、滥用抗菌药物等违法行为。在水产品养殖环节开展以“大菱鲆、乌鳢、鳜鱼”（三鱼）和“孔雀石绿、硝基呋喃”（两药）为重点的水产品集中治理，“三鱼”主产区和“两药”违规使用多发区要有针对性地制定“三鱼两药”专项整治行动方案，加大执法检查和监督抽检力度，严厉打击违法用药行为。
完善畜禽水产品追溯制度
摸清网上销售兽药特别是抗生素的基本情况，调查、收集、整理、汇总假冒兽药企业、发布假兽药信息、无证经营等违法违规形式的网站或第三方交易平台，经核实确认为非法的，依法予以处置。严厉打击利用网络销售硝基呋喃等禁用兽药的行为。
在整治抗生素等兽药残留超标问题方面，以畜禽水产品生产运输环节、市场销售及餐饮环节监督抽检为抓手，扩大对畜禽水产品中抗生素等兽药抽样覆盖范围，增加风险隐患品种抽检数量和频率，切实掌握畜禽水产品质量安全状况。健全完善畜禽水产品追溯管理制度，发现兽药残留超标等问题样品，要实施来源追溯和去向追踪。
