食源性致病菌是食物中毒和食源性疾病暴发的重要因素。畜禽肉中的沙门氏菌是导致人类食物中毒的重要原因之一。我国每年约3亿人因沙门氏菌感染而患病，约占病原菌食源性疾病总数的70%~80%，而引起沙门氏菌中毒的食品90%以上是动物源性食品。国内畜禽肉中沙门氏菌污染的来源极其复杂，畜禽的饲养、屠宰加工、储存、销售等众多环节均可能受污染，其污染源和污染途径多种多样。
为有效控制畜禽产品中沙门氏菌的污染，以便对污染源和污染途径进行针对性监控，重庆市动物疫病预防控制中心研究人员对重庆市屠宰场、农贸市场和超市供应链中畜禽产品的沙门氏菌污染状况进行了初步调查分析，同时对从供应链中分离的沙门氏茵进行18种抗生素的药敏试验。调查结果显示，屠宰环节猪肉中的沙门氏菌污染程度较低，为7.27%；经过运输到达销售环节，其污染程度明显上升，最高的是超市环节，高达64.52%。对其所处的环境进行调查分析，发现屠宰场和超市环境中的沙门氏菌污染较严重，尤其是屠宰场容器（88.89%）、台面（55.56%）和超市刀具（50.00%）、地面（46.67%）；中型规模屠宰场的沙门氏菌污染风险最大。分离菌株对头孢类药物敏感，对磺胺类药物耐药严重，其次为四环素类和β-内酰胺类，多重耐药情况普遍。
探其原因主要在于畜禽肉产品到餐桌前，在流转环节，对山门氏菌的污染途径不能有效控制，尤其在农贸市场和超市销售过程中，畜禽肉产品往往堆放在一起销售，极易引起二次污染，同时销售过程中畜禽肉产品的保存温度和销售时间不能有效控制。这提示在对致病菌监测的同时，应提高畜禽肉产品中致病菌污染的防控技术，从而减少疾病的暴发。同时，沙门氏菌多重耐药的调查结果提示应规范养殖环节抗生素的使用，严禁使用人用抗生素。
