畜禽养殖粪污治理是改善生态环境的重要措施，我市目前已累计完成改造治理380 个畜禽规模养殖场（小区），为全市规范畜禽粪便污水治理立下了标杆，促进了畜牧业发展方式和增长方式转变，实现畜牧业生态、优质、高效、安全发展。
近年来，随着建设畜牧业强市的实施和沈阜200万亩现代农业示范带建设，我市畜禽生产总量和规模化饲养程度显著提升，全市规模化饲养水平达到70%以上。但随着畜禽饲养量的增长及规模化饲养程度的提高，畜禽粪便和污水污染问题比较突出，成为制约畜牧业发展的瓶颈，对自然环境造成了影响。为此，畜牧部门充分利用发改、财政和环保等项目资金实施粪便污水治理工程，扶持改造畜禽规模养殖场（小区），畜禽粪便利用主要建设与养殖规模相适应的防雨、防渗、防溢堆放场，采取发酵堆肥、加工有机肥等模式还田利用；污水治理主要建设多级贮存池，采取多级沉淀、生产沼气模式达标排放。