小型养殖场的粪便随意排放，以致形成环境污染，从一定意义上说，这是一种“浪费”，是物质没有被充分利用的浪费。由于生物的消化率不可能达到百分之百，未被利用的部分被微生物分解，成为臭气的主要来源。对畜禽排泄物进行处理，一来可进一步分解未被消化的饲料残渣；二来消除臭气，让经过处理的畜禽排泄物直接施入土地，促进农作物吸收。而最好的处理方式，就是农村沼气。 目前，各地市州及区市县根据各自的情况，有的是农业局和畜牧局进行合并，有的是农业局和林业局进行合并。畜禽养殖项目由畜牧局下属科室负责实施，农村沼气项目由农能办负责实施，可以说，这两个机构是各自独立并“各自为政”。要促进资源的有效利用，首先要对畜禽养殖和农村沼气进行“整合”，或者让二者协同项目实施，主要针对新建畜禽养殖场而言。即根据新建养殖场的设计规模，同步修建可消化畜禽排泄物产量的沼气池，从起点抓起，促进畜禽排泄物的充分分解。 针对已修建的养殖场，分两种情况。第一种是以家庭为单位的小型养殖场，如生猪存栏数在100头以内的养猪场，由农能办为其设计修建适当大小的沼气池。第二种是中型养殖场，如生猪存栏数几百头甚至更多的，小型沼气池不足以分解排泄物，而修建大型沼气池首先其养殖数量可能达不到项目补贴要求的标准，其次是沼气的产量大于使用量，也会造成浪费。 解决这种情况，要进行第二次“整合”。即把养殖场的沼气由养殖场单独使用，改为由附近居民共同使用，附近居民不再修建户用沼气池，根据养殖场的畜禽排泄物产量，农能办为养殖场设计对应分解能力的沼气池，并把户用沼气池的补贴资金，注入到养殖场修建沼气池中。
