肃南县动物疫病预防控制中心兽医实验室承担着肃南县动物疫病监测、检测和诊断的任务。当前疫情十分复杂，畜禽传染病已成为畜牧业发展的主要障碍因素，由于有些畜禽传染病的临床症状有相似之处，仅仅依靠临床和剖检诊断很难确诊；规模养殖场（户）对控制疫病要求越来越高，迫切要求动物防疫机构为他们提供全方位疫病检测服务；动物防疫机构和规模养殖场（户）都把免疫工作放在首位，但在免疫过程中，由于种种原因导致免疫失败的事件时有发生，必须进行实验室抗体检测。
为科学防控疫病、指导畜禽生产，保障畜产品质量安全，为动物疫病的预防控制提供重要的理论依据和参考凭据。肃南县动物疫病预防控制中心积极开展实验室操作技术培训，采用请进来教、送出去学的方式，提高兽医实验室技术人员操作技能和水平，通过培训，促进了肃南县动物疫病预防控制中心兽医实验室的建设，提高了技术人员素质，提升了肃南县动物疫病预防控制中心兽医实验室的检测水平和管理水平。2014年10月以来，该实验室完成小反刍兽疫血清学检测1420份,牛羊寄生虫病调查检样粪便250份，绵羊内脏5付，牛羊布病检测血样22541份，马蹄乡东城子村、马蹄村、八一村，康乐乡赛鼎村，大河乡金畅河村、大滩村等多起羊只发生急性死亡的实验室诊断
