3月5日报道，韩国畜产科学院饲养的禽类感染H5N8型禽流感病毒（AI）。因此，有人批判称，韩国政府疏忽自行切断防疫，反而将此次禽流感事态的原因归于候鸟。
农林畜产食品部日前表示，在国立畜产科学院畜产资源开发部饲养的鸭子尸体中检测出H5N8型禽流感病毒，与农户家的病毒一样。韩国农食品部认为，2月23日在京畿道平泽一家种鸭农户发病的禽流感病毒蔓延到畜产科学院的可能性较大。畜产科学院位于离该农户半径三公里内。
农食品部在此次事态中每当发现禽流感发病农户时就对半径三公里内的鸡鸭进行屠杀，但对畜产科学院饲育场则以要保存遗传资源为由排除在外。这意味着隔离防疫的水准比普通的农户要高。为此，畜产科学院最近一个月内一直禁止与鸡鸭接触频繁的研究员出入此处。但随着当天在畜产科学院内还是发现了禽流感，韩国民对政府这种隔离防疫能力的信任产生了动摇。
首尔大学兽医学系教授金载弘表示，野生鸟类携带的禽流感病毒可能已经潜入该科学院内部。在调查原因的同时还要重新确认研究所内的防疫实态。农食品部还计划在进行调查的同时，对是否有研究员在禁止出入期间无端出入饲育场进行调查。
到目前为止，在畜产科学院饲养的鸡鸭一共有1.6万只。其中，含有较多作为氨基酸的一种的蛋氨酸、胱氨酸和胶原蛋白因而可以获得结实肉质的"传统朝鲜鸡"也被列入了屠杀对象。
韩政府为应对事态，计划在水原、南原、龙仁、咸平、长城和平昌分散饲养遗传资源保存用鸡鸭。但在作为主要研究场所的天安畜产科学院，所有鸡鸭都被屠杀，所以预计研究工作在相当期间会放缓。畜产科学院完全恢复预计最长需要两年的时间。 农畜振兴厅灾害应对课长表示，"我们会努力尽可能快地展开恢复工作，进行持续研究".