一饲养密度大易滋生疫病
1蛋种鸡群
全自动化高层笼养模式在蛋种鸡养殖中逐渐增多。虽然这类方式提高了土地利用率、人均效率与生产效率；但由于鸡与粪便距离较近，增加了蛋鸡群肠道病多发的可能性。根据调查，自动化饲养的蛋鸡、种鸡，发生坏死性肠炎、慢性小肠球虫病的情况很普遍，甚至饱受鸡盲肠球虫困扰的企业也存在。
2商品肉鸡群
以白羽商品肉鸡为例，正常的网上饲养密度应该是在10～12只/平方米；但通过了解，大部分养殖企业饲养密度达12～14只/平方米。地面平养更是应该减少。较大密度的饲养，会给疾病的发生带来更多机会，发生疫病后控制难度会更大。同时也会导致用药费用增高、成活率降低、体重均匀度差。
二标准化养殖设备防寒能力弱于防暑
规模化养殖场，标准化自动化养殖设备是提高养殖效益的必备条件。这些设备的使用无疑是正确的，但是，据调查显示普遍存在一个共性问题，即防暑效果好，防寒效果差。自动化标准化的家禽养殖设备中湿帘、大型号风机、大型号的加热风炉是主要组成部分。通过调查发现，这些设备在夏季通风换气、鸡舍降温方面有着良好的效果，也完全可以满足防暑、换气的目的，能够为鸡群创造一个良好、舒适的环境。但是到了冬季，通风换气却有差异。普遍以为有了升温良好的热风炉，就可以满足冬季的温度要求，但实际上，换气时风速的调控并不协调。在冬季，舍内最佳风速是0.25m/s，如果风速较长时间不稳定或超过0.5m/s，鸡群就会出现异常。蛋鸡产蛋率下降、蛋重下降，肉鸡就会出现呼吸道病，空气中的风就易成为凉风。凉风及冷风是诱发家禽感冒及温型流感的主要原因，建议家禽舍风速：夏季最好大于0.6m/s，春秋季尽量保持在0.3～0.5m/s，冬季可以保持在0.1～0.2m/s，但是不能超过0.25m/s。
冬季，规模化禽舍风速一定要通过设备微调，使风速稳定在0.25m/s以内；温差不能超过3℃。否则，温和型流感的威胁将很难避免，大型家禽养殖企业不能掉以轻心。
三温和型流感病毒隐性感染率高
近两年我国动物疫病预防控制中心多次提出，有实验室及临床检测得出结论：我国家禽H9流感病毒在腱康鸡群中的隐性感染率在1%～2%，而商品肉鸡则更高。证实H9流感病毒在健康鸡群中不引起发病，如果有其它应激因素发生、其它病原体感染，就会表现出致病性，导致温和型禽流感发生。
如果伴有凉风及冷风等应激因素，H9隐性感染的鸡群会出现典型的温和型禽流感症状及病变。如果是接种疫苗为主要应激因素出现，H9隐性感染的的禽群发病，部分病后表现为非流感症状和病变，而表现出的是疫苗毒引发疫病的主要特点。因此造成很多养殖公司的技术人员误诊，给出错误的控制方案。H9如果已经隐性感染禽群，在其它细菌感染发病后，也会同时引起典型温和型流感病的发生，如大肠杆菌、支原体等。发病后在临床上如果“三炎”病变明显，会导致部分养殖公司误认为是大肠杆菌病，但使用了大量的敏感抗菌药物都无法控制病情。
因此，希望家禽养殖企业重视H9在健康禽群中隐性感染的现象，不能认为条件好、设备好、隔离好就轻视H9隐性感染问题，包括垂直传播问题。
四多病毒多细菌混合感染率高
1商品肉鸡群
H9隐性发病占肉鸡常见疫病发病率的72%，～85%；H9AIv+NDv+MG+多细菌占H9发病率约50%：H9AIv+IBV+MG+多细菌占H9发病率约20%；H9AIv+IBV+NDv+MG+多细菌占H9发病率约20%，H9AIv+MG+多细菌占H9发病率约10%。
不同季节这些发病形式有不同变化，所占比重多有差异；白羽肉鸡更为典型，麻鸡、黄鸡、青年鸡病症或混感性的出现则会相对轻。因此，建议商品肉鸡养殖公司根据以上发病规律，找出相应的预防、控制应对措施。预防病毒病的发生，应该选用中药或广谱抗病毒药物、抗菌药物；尤其在发病后控制过程中更要重视广谱药物的使用。
2蛋种鸡群
规模化蛋种鸡企业遇到最多的疫病应该是温和、型流感、H5、新城疫、慢性小肠球虫、坏死性肠炎。对于禽流感H9/H5的预防，尤其是疫苗预防，规模化养殖企业应该都有较好的方案；操作严谨，禽群AI体液抗体水平往往较高；但是，也很难抵御AIv的感染，只是抗体高的禽群感染AIV后病症轻、危害小、易控制。因为，AI免疫缺乏局部免疫屏障；局部免疫屏障主要体现在呼吸道黏膜、消化道黏膜、眼结膜、泌尿生殖系统等部位。那么，这些部位上皮淋巴组织是否功能完好、是否受损是养殖企业应该关注的防控、保健重点。球虫病、坏死性肠炎也是损害肠绒毛膜、肠黏膜上皮组织的重要因素，因此，同样应该作为养殖企业疫病防控、保健中的重点。平时应该预备一套预防和控制肠炎、球虫病的措施，包括药物的预选等。这些药物要尽可能没有副作用，体现绿色理念。新城疫在蛋种鸡群中发生后多呈非典型，对禽群威胁不是很大；在合理接种疫苗前提下，做好AI防控的疫苗外措施，同样对新城疫的发生有预防作用。
五禽群免疫抑制普遍的威胁
1免疫抑制病毒垂直传播率高
马立克病病毒(MDV)、鸡传染性贫血病病毒(cAv)、禽网状内皮细胞增生症病病毒(REV)、J亚型淋巴白血病(ALv-J)、呼肠弧病病毒(ARV)、AIv。这些病毒都是可以垂直传播，并且隐性感染率极高。健康家禽平均45%～50%的群体都有其中某个或多个病毒感染。在商品肉鸡中一般都不引起发病，症状病变不能通过肉眼判断。它们的存在，给禽群带来严重的免疫抑制，尤其重要的危害是中枢免疫器官发育受阻，导致抗病力差、免疫力低，使禽群不能产生或不能产生足够的抗体，使黏膜免疫、细咆免疫、体液免疫力普遍低下，最终使禽群疫病多发，生产性能降低，影响养殖效益。
家禽养殖企业在对禽群免疫力提升，修复免疫器官发育方面应该采取确实有效的措施，如使用白介素、免疫因子、肽制剂、多糖寡糖类、糖萜素类对禽群提升免疫力方面进行真正的保健，这样才能使禽群疫病少发，保障生产效益最大化。
2损害免疫器官疫病的危害
传染性法氏囊(IBD)、禽流感(AI)、新城疫(ND)是家禽常发的病毒性疫病，发病过程中或康复后，此类病毒对家禽的法氏囊、胸腺、脾脏、淋巴滤泡、局部淋巴组织都会产生严重的损坏。康复后家禽的免疫功能需要很长时间恢复，或永远无法恢复。那么，康复后的禽群能不能接种其它程序疫苗?接种疫苗效果如何?显然回答是否定的。
因此在家禽患IBD、AI、ND康复后，建议养殖企业能重视采用合理的措施修复造成的免疫抑制，有利于后期的抗病力、免疫力的增加，保障后期禽群健康。
六接种疫苗诱发疫病的威胁
由于H9的垂直传播率隐眭感染率高、免疫抑制病毒垂直传播率高等因素的存在，表明我国家禽群体亚健康或临发病状态普遍存在。因此，应激则成为诱发禽群发病的重要因素，如物理应激、化学应激、生物应激、饲养管理应激、精神应激等。临床上饲养管理应激是最主要的应激，其中接种疫苗应激已经成为家禽发病的致病条件。
因此，建议养殖企业在对家禽进行接种疫苗前，尽可能先用提升免疫力、尤其是抗H9病毒的药物，清除或抑制隐性感染的H9病毒，同时提升免疫力防止接种疫苗发病。如果能够做到此项措施，尤其是商品肉鸡养殖发病率可以减少80%
七蛋禽生殖系统损害-恢复难
威胁商品蛋鸡及种鸡最主要的疫病是H9、H5、ND等，这几个疫病一旦发生，即使控制再及时体质再好，也避免不了此病对生产性能的影响。康复后，蛋壳质量差、畸形蛋多、产蛋率持续不升成为主要问题，这些后遗症经常威胁蛋禽行业。
如何应对这个问题?行业中有人做了大量的论证，其中效果显著值得借鉴的措施很少。效果最显著的是强制换羽。通过强制换羽，可使康复后的禽群产蛋率恢复到90%左右。第二个方法，应该考虑淘汰不产蛋的鸡只，然后用促进脑垂体释放促性腺激素的药物，如二氢吡啶等，同时配合中药调理生殖系统功能的中药制剂。它一方面可以消除输卵管的炎性变化，消除子宫黏膜的水肿，一方面可以促进卵泡的发育。同时，用维生素E、A采满足生殖系统修复过程的需求。蛋种鸡养殖公司应该预备一套有效的措施，来应对危害生殖系统功能的疾病。
