震后灾区一是畜禽舍大部分毁坏，饲养环境改变；二是大量畜禽被压死、饿死，病原微生物在尸体上滋生，尸体腐烂，病原大量扩散；三是地面裂缝、山体坍塌，土壤中的大量病原微生物被暴露，污染水源等环境；四是大部分畜禽抵抗力下降，容易受到疫病的侵袭；五是次生灾害如暴雨、暴雪、大风等引起病原菌扩散；六是防疫设施不健全，制约了防控工作的开展。灾后发生的动物疫病中，对人和动物威胁比较大的是人畜共患病传染病，病毒类的有狂犬病等，细菌类的有牛、羊炭疽等，寄生虫类的有钩端螺旋体病和猪囊虫病等。
根据动物疫病发生的特点以及防治环节，当前主要应抓好病死畜禽的处理、饲养场舍以及环境的消毒、免疫接种、畜禽及其产品的检疫、疫情监测，以及防止动物霉变饲料中毒等工作。具体应做好如下几点：
一、及时无害化处理死亡畜禽
病死畜禽体内带有大量致病微生物，必须进行无害化处理。最简单有效的处理方法是将死亡的畜禽进行深埋，应选择高岗地带，坑深应在2米以上，尸体入坑后，洒上石灰或消毒药水，覆以厚土。在有条件的地方，也可以焚烧。禁止贩卖屠宰病死畜，确保灾后无大疫。
二、做好灾后消毒工作
灾后，要对辖区内的养殖环境和畜禽圈舍进行一次全面彻底的消毒工作，避免病原与畜禽群体的直接接触，降低发生动物疫病的风险。其中，消毒的重点地方有畜禽舍、屠宰场（点）、畜禽及其产品加工销售场地、仓库、中转场地、牲畜市场、农贸市场、饮水源、畜禽运输车辆等。消毒方法有日晒、焚烧、堆积发酵等物理消毒、生物消毒和化学消毒，其中化学消毒方法应用最为广泛。
三、加强免疫工作
在灾区开展动物疫病紧急免疫工作。按照分类指导的原则，对重大动物疫病、人畜共患传染病和其他动物疫病逐步开展紧急免疫工作。灾后，特别要加强炭疽、狂犬病、高致病性禽流感、口蹄疫、猪瘟、高致病性猪蓝耳病以及牛出血性败血症、牛病毒性腹泻、犊牛副伤寒、羊痘、羊猝疽、羊快疫、羊肠毒血症、羊黑疫等其他动物疫病的紧急免疫。对于其它畜禽传染病，也要根据疫情动态，做好预防接种工作。对养殖规模较大的养殖场要及时采集样品进行免疫抗体监测，发现免疫抗体未达标的畜禽群体，应及时补免，避免疫情的发生。
四、加强疫情监测和报告工作
加强疫情监测和疫情报告的目的，在于及时准确地掌握疫情动态，以便迅速采取防范和扑灭措施，防止疫情扩散。应安排兽医巡回小分队，深入基层调查了解情况，及时掌握疫情动态。发现疫情要及时诊断，按程序及时上报，并组织力量扑灭。要严格按照《动物防疫法》等有关规定，对疫点进行封锁，对病畜及同群畜进行扑杀，防止疫情扩散。同时，各地应加强动物疫病流行病学调查工作，及时掌握可能出现的疫情情况，避免大面积疫情发生。
