改革开放以来，我国畜牧业稳步发展，无论是畜禽的饲养量，还是畜牧业产品产量及人均占有量都呈明显的上升趋势。畜牧业发展开始由传统畜牧业向现代畜牧业转变。畜牧业的发展对于建设现代农业，促进农民增收和加快社会主义新农村建设，提高人民群众生活水平都具有十分重要的意义。但畜牧业发展中，也逐渐暴露出一系列的问题。总的来看，中国的畜牧业仍处在传统饲养方式与现代化养殖方式并存、传统养殖方式占支配地位阶段。规模小、品种杂，人畜混居、散放散养、混放混养、粗放经营。
一、畜牧业发展中存在的主要问题
1．农村居民生产和生活环境恶化。随着经济发展，一家一户的养殖方式已经不能满足市场增长的需要。尤其是改革开放以后，小农经济也开始加速向商品经济转化，在农户家庭养殖这一基本事实没有改变的情况下，畜禽规模的扩大意味着牲畜与人争空间。多数家庭畜禽养殖户环境较差，粪便满地，臭气熏天。夏天苍蝇、蚊虫肆虐；污水横流，造成浅表水源污染，造成农村居民生产和生活环境严重恶化。
2．扩大再生产和增加农民收入的约束。农区家庭养殖方式，不仅是生产生活环境的问题，畜牧业发展到今天，即使朴实的村民能够忍受长年累月的气味和粪便污染，但扩大生产规模的要求却难以满足。由于市场需求的扩大和农民增收的需要，房前屋后的家庭养殖及放养已经没有扩大生产所需要的空间，农民迫切需要有足够的饲养场地扩大畜禽生产，增加出栏量，提高收入。
3．畜产品质量问题突出。受利益驱动，部分养殖户会采用不恰当的饲养方法和手段生产劣质甚至有毒的畜产品。在过去几年间，“瘦肉精”、苏丹红等事件接连不断，对城乡居民的身体健康及消费心理造成了严重影响。但是传统养殖方式下，利润追逐和道德法律冲突问题频频发生，加之养殖户高度分散，难于管理，不能保证上市畜产品符合无公害标准。
4．小生产和大市场矛盾。畜产品是我国的优势农产品，加入WTO后，希望畜产品能够增加出口。但由于传统养殖方式的缺陷，难以形成加工出口要求的规模，产品标准化程度低，影响了加工业和出口竞争。
5．疫病防治困难。由于大量的分散饲养，难以有效的防止交叉传染、控制动物疫病、建立公共卫生防疫和环境控制标准。
6．难以抵御市场波动风险。传统养殖方式，不能预测和适应市场变化，无法受市场价格波动所带来的风险，对畜禽业的整个产业波动起推波助澜的作用。
二、解决问题的对策
1．建立现代化的品种繁育及推广体系。优良畜禽品种是现代化畜禽养殖的关键，建立现代化的品种繁育推广体系是优良畜禽供应的保障。现代化的品种繁育推广体系要能够适应市场的需要，不断引进、繁育和推广生产率较高的优良品种。目前，我国的优良品种率占整个畜禽存栏的比率不断增加，但仍有待提高，有些品种还不适应市场变化的需要。如我国的黑白花奶牛中纯种牛所占比例不足50％。在过去几年的超高速发展中，优良奶牛供不应求，价格居高不下，很多奶牛以次充好，在全国范围内流通，造成全行业奶牛平均单产较低的状况；再如我国的细毛羊产业，羊毛细度以66-68支毛为主体毛，且羊毛品质不断下降，68支以上羊毛比重下降，与国内纺织企业大量需求的70支以上羊毛不相适应。据统计，我国有种畜禽场9000多个，但大部分种畜禽场功能不佳，种畜禽销售困难，生产难以为继，难以承担起现代化品种繁育推广的任务。有些企业已经改制，更难适应市场的要求进行生产。
2．建立有效的疫病防治体系。疫病是影响畜禽养殖业的主要因素，控制疫病的产生和传播，需要有现代化的防治体系做保证。每种畜禽都有相应的科学防治“标准”和“办法”，这些方案的实施“标准”和“办法”要以一系列的制度、组织系统和工程技术措施做保证。由于传统养殖方式下，难以实施疫病控制措施，造成我国畜禽的死亡率偏高，其中猪禽羊的病死率分别为10％、20％和8％，导致了大量的饲料和人工浪费，甚至殃及整个企业或产业。
3．改革和完善饲料作物生产加工体系。要充分考虑我国的自然资源条件，发展饲料种植业和饲料加工业。我国是一个饲料资源短缺的国家，应适应这种资源状况调整畜禽结构和饲料结构。北方干旱地区，要大力提倡三元种植结构，发展草食动物。我国有17％的粮食作为饲料，这是不科学的，不经济的。每年生产的7亿吨作物秸秆，经氨化处理的秸秆相当于0．4个饲料单位，约合2．8亿吨饲料。饲料是畜禽生长的基础，也是控制畜禽产品质量的关键。在提高饲料报酬的同时，保证畜禽产品质量，是现代化饲料体系
的特征。
4．建立和推广现代化的饲养设施和设备。畜禽养殖现代化外在的标志是设施和设备的现代化。包括圈舍、饲养设备、饲料加工、饲喂、饲养室清洁、产品收集、产品运输、产品库存等。现代化的饲养场，应有封闭的场房，检测设备，消毒设施齐全，为生产高品质的畜产品提供保障。如牛奶生产必须拥有检测设备和机械挤奶设备，严禁人工挤奶，减少细菌污染和其他杂物污染；细毛羊剪毛必须利用固定或移动剪毛棚，实行机械剪毛，减少重剪毛和短毛。
5．建立现代化的环境保护标准和设施。由于现代化的养殖方式实行集约经营，畜群规模大，更容易产生环境污染。所以必须按现代化的标准处理畜禽粪便、废物、动物死尸、污水等，饲养场要建设一定的环保设施，在保证各项经济技术指标先进的情况下，保证环境指标达标。政府应对环境保护的投入给予必要的补贴。
6．建立现代化的管理系统。现代化的养殖方式，要求现代化的管理。传统的经验管理无法适应现代饲养设备设施和现代产品标准。养殖场要配备专业技术型管理人员，要准确掌握市场变化趋势，加强经济核算，科学决策，使养殖获得最佳的经济效益和社会效益。
