近年来，我国在重大动物疫病防控方面实施了以“三补一建”为主的扶持政策。“三补”指重大动物疫病强制免疫补助、强制扑杀补贴和基层动物防疫工作补助；“一建”指动物防疫体系建设。这些政策惠及广大养殖场户，对提升我国动物疫病防控能力和水平发挥了重要作用。
自2001年起，我国实行对牲畜口蹄疫进行强制免疫，2005年开始对禽流感进行强制免疫，2007年开始对高致病性猪蓝耳病、猪瘟和小反刍兽疫进行强制免疫。“十一五”期间，中央财政投入各类强制免疫疫苗经费近120亿元，重大动物强制免疫补助政策使全国禽流感等重大动物疫情逐年下降，疫情起数明显减少，疫情范围明显缩小。
目前，我国对高致病性禽流感、口蹄疫、高致病性猪蓝耳病、小反刍兽疫发病畜禽和布病、结核病检测阳性奶牛实施重大动物疫病强制扑杀经费补贴。近年来，中央财政投入强制扑杀补助经费近4.5亿元，通过这项政策，减少了养殖户的损失，调动了养殖户防疫积极性。
同时，近年来，中央财政对基层动物防疫工作给予稳定的经费补助，提高村级防疫员待遇。2008年~2010年，中央财政每年安排基层动物防疫工作补助经费6.5亿元。今年7月，中央财政又将基层动物防疫工作补助标准提高到1200元/人/年。
此外，动物防疫体系的建设对改善防疫基础设施、扩内需、促增长发挥了积极作用。“十一五”期间，国家组织实施了《全国动物防疫体系建设规划》，全国动物防疫体系建设累计投入资金83.8亿元，初步形成了覆盖全国的中央、省、县、乡四级防疫网络，建立健全了动物疫病监测预警、预防控制、检疫监督、兽药监察，防疫技术支撑和物资保障等系统，形成了上下贯通、横向协调、有效运转、保障有力的动物防疫体系，提高了重大动物疫病预防、控制和扑灭能力，兽药质量监察和兽药残留监控能力和动物及动物产品质量安全追溯能力。
