莫旗在学习实践科学发展观活动中，着眼于跳出传统畜牧业的思维框架，充分利用地缘优势、政策优势和周边市场优势，大力实施“五大工程”，助推畜牧业科学发展。
这“五大工程”分别是牲畜良种繁育工程、动物疫病防治工程、规模化养殖工程、壮大饲草料工程、培育龙头企业工程。全面启动牲畜改良“种子工程”，全旗共设置牛羊改良站点８０处，大小牲畜良种改良比重达到９２．８％。其中，牛改良配种完成４．３万头，绵羊改良完成７．６５万只。积极推进旗畜牧业试验站、腾克村标准化养殖小区和额尔根浅村奶牛标准化养殖小区等建设项目。加快实施红彦、腾克、塔温敖宝１０个乡镇、办事处基层畜牧兽医站建设项目。进一步加强畜产品质量安全管理工作，构建饲草料生产体系，确保动物重点疫病防疫率达到１００％。
目前，全旗规模化养牛户达到１０９２户，存栏１．６万头，其中奶牛存栏５２００头、养殖户１０８０户；规模化养羊户达到４２１０户，存栏４６万只。２００９年，全旗畜牧业存栏总数力争达到２４０万头（只）。完成草原围封２０万亩，休牧１９０万亩，禁牧３０万亩，推广饲料作物种植３９．７万亩，年度青贮玉米储量达到４．５４亿公斤。２００９年全旗计划种植饲草料作物２１万亩。
这个旗还实施“南乳北肉”的畜牧业发展战略，积极培育牛元、草原清江、蒙鹅等一批畜牧业龙头企业，进一步发展壮大肉牛基地、奶源基地、肉羊基地和大鹅基地。２００８年，蒙鹅等产业化龙头企业实现销售收入１０．１８７２亿元，完成增加值１．０８亿元，辐射带动农户２３１００户。
