近年来，我国的中药产业化水平获得了一定的提升，但是在产业化创新能力和支撑能力等诸多方面还存在不足，严重制约了中药产业的可持续发展。笔者认为主要存在以下问题：
中药创新能力不足，创新体系有待进一步完善。长期以来，由于中药基础研究和创新能力不足，发展结构失衡，尤其是在中药饮片炮制技术传承和创新、中药技术标准和安全保障体系、中药辅料技术体系、名优大产品二次开发等方面，致使中药新品种市场竞争力差，传统品种增长乏力，中药产业发展后劲不足。
中药资源可持续利用的支撑能力不够。由于中药资源破坏严重、资源流失问题突出，加之中药材基地布局不合理、监管主体缺失、资源保护责权不明、中药资源保护投入主体不清、融资渠道不畅，致使资源基础数据缺失、资源监测网络不全、资源预警机制尚未建立。随着产业化规模的扩大，资源的可持续和合理利用问题将日益突出，影响产业持续发展。
中医药防治重大疾病的能力亟待加强。我国面临着传染病和慢性非传染病的双重威胁，心脑血管病、恶性肿瘤、肝病、抑郁症、糖尿病、更年期综合症等重大疾病的发病率大幅攀升，艾滋病、病毒性肝炎、流感等病毒性疾病已严重威胁人民的健康，这虽然给中药发展赢得了机遇，但基础研究投入和创新能力薄弱，已经严重影响中药在这轮竞争中的有效发挥。
“旗舰”企业缺失，龙头企业辐射带动能力差，国际竞争能力弱。我国中药产业尽管维持较高的发展速度，但中药工业基础薄弱，经营企业在政府强制降价导向下利润增长受限，企业自觉加强技术创新和核心竞争能力培育、主动参与国际竞争的意识还相当缺乏，“旗舰”型的中药企业集团和产业集中度较高的产业集群形成缓慢，在全球经济一体化和日益激烈的国际竞争态势下，中药产业发展将面临前所未有的压力。
