每种诊断方法都有自己的优点和局限性。完成一次诊断监测工作，往往需要综合运用几种方法，才能获得及时、完整的诊断监测结果。根据检测工作的性质、工作量和疫病控制的需要，可以采取不同的技术方案。
（一）临床快速诊断
出现疑似禽流感（尤其是高致病力禽流感）病例时，需要在最短的时间内作出诊断。可以先用快速诊断技术作初步判断：
1. 现场快速诊断：
免疫胶体金试纸条可以现场操作，直接取喉气管、泄殖腔棉拭检测，无须仪器设备，操作简单，10分钟内即可初步判断是否有禽流感病毒存在。
2. 实验室快速诊断
采用RT-PCR检测技术，可以直接鉴定AIV的型和亚型。
3. 其它快速检测方法
包括免疫酶渗滤法和免疫荧光法检测禽流感病毒，如果采用血凝素特异性的单克隆抗体，还可以初步鉴定病毒的血凝素亚型。
采用血凝素特异性的单克隆抗体介导的抗原捕获ELISA，还可以初步鉴定病毒的血凝素亚型。
当然，依靠快速诊断技术仅能作出初步诊断，进一步确诊还需做病毒分离、RT-PCR检测，必要时需测定病毒的静脉接种致病指数。
（二）小样本量的监测
血清学监测：少量血清样本（500份以下），可直接使用各种亚型的血凝素抗原进行HI试验，检测抗体是否存在以及抗体水平高低。对于免疫群体，应侧重分析抗体水平和离散度，评估群体的免疫状态和感染风险。
病原学监测：对于少量的样本（50份以下），可直接进行RT-PCR检测或接种鸡胚分离病毒。
（三）大样本量监测
血清学监测：应首先采用（针对NP、H5、H7抗体的）间接ELISA对血清样品进行初步筛选，以提高检测效率，对ELISA检测为阴性的样本，不必进一步检测；对筛选出的阳性样品再进行HI检测，以确定亚型。免疫群体可分析抗体水平的高低和离散度，评估群体的免疫状态和感染风险。必要时可采样进行病原学检测。
病原学监测：对于大批量的样本，可用抗原捕获ELISA对样品进行筛选。对阴性样品，不必进一步检测。对阳性和可疑的样品进行RT-PCR检测或接种鸡胚分离病毒。