每批鸡出栏后，进新鸡前，要对鸡舍及各种设备用具进行清扫消毒。
首先，清扫鸡舍内的灰尘、羽毛、粪便、垫料等污物；地面及网面用高压水枪冲洗干净，再用消毒液消毒；料槽、水槽等用具用水洗刷干净，消毒液浸泡消毒，再用清水洗净，待消毒液干燥后，放入鸡舍，空舍半个月以上，如果上批鸡发生过传染性法氏囊等疾病，则必须空舍1个月以上。其具体的消杀注意事项是：
一、鸡舍常规消毒程序
洒水防尘→消除鸡粪→搬出可移动器具→清扫鸡舍→高压水枪由高到低冲洗→自然干燥一会（半干半湿）→喷消毒液至屋顶墙壁和地面→干燥→搬进消毒过的器具→甲醛熏蒸鸡舍→密闭2天→通风空舍7天→方可进鸡（如急用，可熏蒸24小时，通风24小时后使用）。
二、坚持定期、常规、预防消毒，每周至少2次以上。
三、把握消毒时机。全进前、全进后、发病前后等都要按规定要求程序彻底消毒。
四、请轮换使用消毒药物，以免作用单一式而产生耐药性，可隔几次换一种也可轮换使用。
五、消毒剂的选择，要根据带鸡还是空舍，杀菌还是杀毒等不同的要求，合理选择不同消毒药物。醇、表面活性剂、染料、齿素类等只能杀灭细菌；而氯制剂、碱、氧化剂等才能杀灭病毒。
六、饮水消毒常用季铵盐和碘制剂，免疫前后2天和给药前后1天，不可饮水消毒。
七、喷雾带鸡消毒时，雾粒大小在80~120微米效果最佳。鸡舍湿度控制在70~80%。
八、进鸡前鸡舍可用甲醛熏蒸，室内温度控制在20℃以上，干石灰不能很好发挥消毒作用，只有石灰水才能消毒。
九、重视机械清除，禽舍内要及时除粪，清扫，然后再使用消毒剂消毒效果好，以免有机物等干扰。
十、不可忽视周围外部环境消毒，尤其是进场通道，饲养员的服装、鞋、靴、车、等传播途径的消毒，切断传染源。保证消毒效果。
