防治本病最主要的是要做好预防工作，改善鸭场的饲养管理和卫生条件，尽量减少不良应激，建立合理完善的消毒和防疫制度。我国目前应用较多的是各种佐剂的灭活苗，采用灭活疫苗免疫鸭群，一般需要免疫两次才能得到较为有效的保护力，肉鸭在7～10日龄进行首次免疫，每只肌肉注射或皮下注射0.2～0.5毫升，相隔1～2周后进行二免。由于鸭疫里默氏杆菌的血清型较多，不同地区、不同时期流行的血清型有所不同，甚至同一鸭场、同一批鸭群也可能同时存在多个血清型，而且本病常常继发大肠杆菌病，因此有条件的鸭场可针对当地流行血清型，自行筛选相应同型菌株研制疫苗，或委托高等院校和科研院所制作多价“鸭疫里默氏杆菌+大肠杆菌”二联灭活疫苗进行预防接种。
多种抗生素及磺胺类药物对本病均有一定的防治效果，一般可选用下列药物治疗：（1）5％氟苯尼考，按0.2％的比例拌饲料饲喂，连用5天，重症病鸭每公斤体重用25毫克肌肉注射，连用2天。（2）复方敌菌净，按0.04％的比例拌饲料喂服，连用4～6天。（3）用25～50毫克/升恩诺沙星水溶液给病鸭自由饮水，连用5天，同时添加多种维生素。用药前最好进行药敏试验，有针对性地用药，并注意交叉用药，尽量减少预防用药，尽可能采用注射途径，口服选择饮水给药。
