慢性禽流感多发于野禽中，通常患病野禽只会显现轻微症状，甚至根本观察不到任何发病症状。各种日龄的家禽都可发生，但临床主要多发现于蛋禽群，尤其蛋鸡、蛋鸭。本病一年四季均可发生，但主要多发于秋冬季节，尤其是秋冬交界、冬春交界气候变化大的时节。气候多变，饲养管理不当，密度过大，通风不良，有害气体过多损伤上呼吸道黏膜，都是低致病性禽流感发生的诱因，也极易造成细菌和病毒的多重感染，尤其是呼吸道病毒最易感染。
慢性禽流感临床症状鸡初期表现体温升高，精神沉郁，叫声减小，缩颈，嗜睡，采食量减少或急骤下降，嗉囊空虚，排黄绿色稀便。呼吸困难，咳嗽，打喷嚏，张口呼吸。后期部分鸡只有神经症状，表现头颈向后仰，抽搐，运动失调，瘫痪等。产蛋鸡感染后，蛋壳质量变差、畸形蛋增多，会出现软壳蛋、无壳蛋、退色蛋等。2天~3天产蛋开始下降，7天~14天产蛋可下降到5%~10%,严重的鸡可停止产蛋。持续1周~5周产蛋开始上升，但恢复不到原来的水平。一般经1个月~2个月逐渐恢复到90%~70%的水平。种鸡还表现种蛋受精率下降20%~40%,并导致10%左右的死胚，苗雏弱雏率增加，10%~20%的雏鸡在1周内出现死亡。
