鱼虾类育苗中的致病因素：一是育苗池水环境不良。由于鱼虾类幼体培育密度较高，投饵量较大，其残饵和代谢废物的累积易使池水环境变差，病原微生物滋生，引起幼体致病。在育苗过程中使用中草药防病，可以调节幼体的代谢平衡，影响育苗池水环境，起到防病作用。
二是幼体的饵料营养不良。在虾蟹育苗过程中，较多地使用人工饵料，常常造成幼体消化吸收不良，营养不全，使幼体体质下降，对病原菌的抵抗力减弱，而容易患病。中草药对部分营养失调的饵料可起到一定的平衡作用，防止疾病发生。此外，有些中草药还具有明显的诱食性。
三是有害微生物。虽然在鱼虾类育苗过程中对育苗用水进行了选择、沉淀、砂滤、消毒处理，但细菌、真菌、病毒等有害微生物不可能完全被杀灭，随着育苗的进行，它们会滋生、发展、侵害幼体。
一种中草药往往含有多种化学成分，但不是所有的成分都能起到防治疾病的作用，能防治疾病的有效成分主要包括多糖、生物碱、甙类、挥发油、鞣质等。
大蒜：具有广谱抗菌作用，对病毒和原虫等都有杀灭作用，属高效抗菌杀虫中草药。在用作杀菌剂时，应新鲜制备，立即使用。
黄连：其有效成分为小檗碱（即黄连素）。黄连具有广谱抗菌作用，能抑制多种革兰氏阳性和阴性细菌的生长，对多种真菌有抑制作用，对一些病毒、原虫等也有效。另外，小檗碱还具有增强动物吞噬细胞吞噬能力的作用。
黄芩：黄芩甙元是其主要有效成分。黄芩具有较广的抗菌谱，对革兰氏阴性和阳性球菌均有抑制作用，对一些病毒和多种真菌也有一定效果。
大黄：含有大黄素、大黄酸、芦荟大黄素等葸醌类衍生物，具有抗菌、抗真菌、抗病毒的作用，对屈桡杆菌有明显的抑制作用。此外，还具有收敛、泻下、增加血小板、促进血液凝固的作用。 五倍子：含有鞣质等成分，对革兰氏阳性和阴性均有抑制作用，对真菌（水霉病）具有良好的防治效果，还具有止血、解毒、收敛等作用。
大青叶和板蓝根：其有效成分为大青素、靛甙等。二者均有广抗菌和抗病毒作用及清热解毒作用。其中板蓝根的抗病毒作用较强。