蚂蟥是环节动物门蛭纲的一些种类的俗称，也叫水蛭。许多地方在黄鳝养殖中出现大量蚂蟥寄生黄鳝体表引起黄鳝逐步死亡的现象，特别是在稻田等浅水中养黄鳝时更为严重。一般养殖密度越大，传染速度越快，死亡量也从少到多最后大量死亡。由于黄鳝是一种无鳞鱼，体表血管丰富，因而蚂蟥极易寄生。在调查中发现，从5～7厘米长的当年鳝苗种一直到成鳝、亲鳝都有寄生蚂蟥的可能。
因而养殖黄鳝必须对蚂蟥的危害有足够的认识。切实做好蚂蟥的防治工作。主要应做好以下几点：
1、在选择养殖黄鳝的水域时，应事前调查了解该水域是否有蚂蟥出没，如果水域中蚂蟥很多，进水时应采取过滤处理等措施，防止引入蚂蟥。否则，不宜作黄鳝养殖场地。
2、对养鳝水体，尤其是稻田养鳝水体，下鳝种前应进行彻底清整消毒。一般每1亩用生石灰100公斤左右，并翻动表泥后加水深10厘米浸泡10天左右，有条件的可测定水体pH值，使池水pH值维持在9达3天以上。
3、黄鳝下池前仔细检查，如有蚂蟥寄生应针对性地进行处理。处理方法有多种，可以用2%浓度的食盐水浸洗10分钟使水蛭完全从鳝体脱落，但病鳝易死亡；也可使用硫酸铜，用量为10毫克/升，浸洗黄鳝5～10分钟，能使水蛭脱落致死，但要合理使用，方法得当，否则易出现死鳝现象。另外，可用蛭敏2000浸泡处理，一般使用浓度为每吨水用药5毫升（约5克），浸泡6～7小时蚂蟥可全部脱落，每吨水用药10毫升则一般浸泡1～2小时蚂蟥即可全部脱落。据实践，以蛭敏2000使用最为安全，效果极佳，但缺点是浸泡时间较长，药价较高。
4、在黄鳝养殖过程中如出现蚂蟥寄生，最好的方法是用蛭敏2000，每吨水用药5毫升全池遍洒。其次是先将黄鳝捕起采用浸泡处理方法处理黄鳝体表的蚂蟥，然后养殖池用硫酸铜10毫克/升全池遍洒消毒，杀灭池中残存的蚂蟥，再就是做半牺牲性处理，直接向池中遍洒高浓度的硫酸铜，用这种方法池中应有较深洞穴或水草可供黄鳝伸出水面或躲藏。这种方法会将部分黄鳝杀死，应权衡使用，并及时换水。
5、对于初次养鳝或技术欠佳者，不宜盲目追求高密度，如稻田养鳝每亩产量应控制在400公斤以下，这样可降低黄鳝之间的相互感染。为慎重起见，在给黄鳝使用新药时，用药前应做少量预备用药尝试。以防同名药及假药造成不必要的损失。