由于低致病力禽流感感染后往往引起鸡的免疫应答水平低下，机体的抵抗力弱，所以发生一段时间后常伴有大肠杆菌的混合感染，在临床上往往会误认为仅是大肠杆菌感染而只用抗菌素治疗，常常是用药后病情似有好转，但很快又会复发，尽管花费了大量的治疗费用，但效果却不佳。
低致病力禽流感与鸡大肠杆菌病混合感染后，病鸡除了上述禽流感感染的症状与病变外，还常可见到大肠杆菌感染的典型病变。除鸡群在长时间内有零星死亡外，病鸡消瘦，内脏器官有明显的纤维素性渗出物，如纤维素性的心包炎、肝周炎、气囊炎、腹膜炎等。如果是产蛋鸡还常伴有卵泡破裂、腹腔内有卵黄性物质堆积等。
