马杜霉素推荐使用剂量是5毫克/公斤饲料，在此使用范围内安全可靠，无明显的毒性作用。超过6毫克/公斤就对鸡的生长有明显的抑制作用，饲料利用率下降。超过7毫克/公斤的浓度混饲，即可引起鸡不同程度的中毒。 临床上马杜霉素中毒的原因主要是由以下几种情况造成的。
1、用量过大造成中毒。 有的养鸡户为了达到较好的防治效果，擅自加大剂量或重复用药造成中毒，马杜霉素在兽药市场上常以不同商品名出现，如 “加福”、“杜球”、“抗球王”等，还有的生产厂家在标签上没有标明其有效成分和含量，造成用户在联合用药治疗球虫病时将多种马杜霉素制剂同时使用；在使用成品饲料时，不了解饲料中已添加的抗球虫药物，重复使用造成浪费和中毒。此外，在使用溶液剂饮水给药时，夏天鸡只的饮水量大，也会造成摄入过量而导致中毒。
2、饲料混合不均导致中毒。 由于马杜霉素用量小而难以确保其在饲料中混合均匀，故极易使局部浓度过高而引起中毒。向饲料中加入马杜霉素时，由于二者的颗粒直径相差很大，人工搅拌很难混匀，从而造成药物在饲料中分布不均匀。另外，有些养鸡户的饲料为人工配制，混合时不是单一混合，而是将各种饲料成分放在一起进行混合，人工搅拌不充分，导致部分饲料中的马杜霉素含量过高。
3、与其他药物联合使用产生中毒。 马杜霉素不能与某些抗生素联合使用。如饲喂含马杜霉素饲料的鸡在发生霉形体感染时，使用泰乐菌素、泰妙菌素治疗而加大了马杜霉素的毒性。
