一是长期使用痢特灵引起抗药性，使药物失去疗效，还会引起出血综合征，导致鸡只消瘦，生长不良，最终死亡。蛋鸡使用可减少产蛋，病鸡使用同时又加重肝肾负担，损伤肝肾，加重病情。
二是治疗量与中毒量差别不大。过去用于治疗禽类肠炎和球虫病等治疗量一般为0.04％拌料，且不溶于水，故不能饮水使用。而中毒量为0.06％以上，治疗量与中毒量十分接近，故在实际应用中不易掌握。量小了达不到治疗效果，量大了引起中毒。
三是长期使用痢特灵，在鸡肝、鸡肉、猪肝、猪肉中有残留，对人体健康有影响。其残留药物能破坏人的造血系统，引起溶血性充血症、粒细胞缺乏症、血小板减少症，还可能引起人的神经炎，且无特效药物治疗。
