造成雏鸡糊肛的原因并不只有疾病原因，某些生理因素也会造成这种因素
第一 应激 刚出壳的雏鸡由于自身体温调节中枢发育不成熟，对外界的环境反应十分敏感，当外界环境发生急剧变化时，不能有效调整自己的体温，加之免疫力低下，而引起消化系统症状，排出的粪便稀稠不一，引起糊肛。
第二 脱水后暴饮 由于长途运输或初饮过迟，雏鸡脱水而引起血液浓缩，导致肾脏苍白肿大，尿酸盐沉积。此时如果大量补充不含电解质的常水，雏鸡就会因高渗水而发生腹泻，排出粘液状的白色稀粪，粪便黏着于肛周绒毛引起糊肛，严重者发生水中毒引起急性死亡。
第三. 饮水中糖分含量高 为了防止雏鸡因失水而影响生理活动，通常在初饮水中添加葡萄糖、维生素和抗生素，由于饮水中的葡萄糖的浓度较高或饮用时间较长，引起肠道内容物粘性增加，排除的粪便粘在肛门周围，造成糊肛。
最后. 消化不良 是雏鸡发生糊肛症最常见的原因。刚出壳的雏鸡消化器官容积小，消化机能尚未发育健全，如果用含粗蛋白较高的饲料开食，或开食过晚造成雏鸡过食，都易引起消化不良而发生糊肛。
