EM菌是一种新型的复合微生态制剂，呈棕色半透明状液体，pH值在3．5～4．5之间，由光合细菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌、醋酸杆菌等微生物复合培养而成，它有多种功能，概括起来主要有：促进动物生长、提高饲料的利用率、增强机体抗病性能、去除粪便恶臭、改善生态环境等。有人这样评价EM菌：它是集经济、社会、生态效益于一身的优良生物制剂，它的推广和普及必将引起养殖业的一场变革。那么水产养殖该何时、怎样使用EM菌呢?
下面从几方面阐述删菌的使用及方法。
1．池塘在春天注水后使用
渔塘清塘后，向塘里注水，每亩用1～2千克EM菌，代替石灰均匀喷洒，起到净化水体的目的。用时要注意两方面：一是要等到清塘药物毒性失去后喷洒；二是不能和石灰同时使用。
2．定期在池塘中使用
在鱼种放养后，每亩用1千克“调水王”定期泼洒水面，开始15天一次，以后1个月一次，若发现水质有恶化迹象，用量应增加。
3．投喂颗粒料时使用
由于EM菌具有节省饲料，降低成本，提高水产品品质等功能，所以在喂颗粒料时，可用较高浓度的刚菌稀释液喷洒颗粒料，以喷湿为度，喷完之后立目口就喂。
4. 渔塘使用粪便时使用
使用粪便肥水或作饲料时，都要发酵，然后再使用。如果在发酵过程中用EM菌处理，效果会更佳，它不但可以除氨去臭，还可以杀灭有害菌，具体用量为：“调水王”与粪便比例为1：(200～300)。
5．防治鱼病上使用
在鱼病季节到来之前，如“大麦黄”时，草鱼肠炎病流行，此时可用EM菌拌饵，能够有效地预防肠炎病的发生流行。
EM菌在水产养殖上的应用与其发挥的作用越来越明显，深受养殖户的青睐，但我们在使用时也要注意以下几方面问
题：
1．EM菌不能与杀菌药物、抑菌药物同时使用(若要使用药物应相隔5天以上)。
EM菌应持续使用，一般间隔在15～30天使用一次。
2．水质恶化、底质污染严重的要加量使用(也可以配合其他的化学性改底产品“底净宝”使用)。
3．EM菌应在晴天上午使用，因为EM菌的活化和繁殖需要耗氧，防止造成池水缺氧。
4. EM菌应在常温下，避光保存。