当前，对我国肉鸭养殖业危害较大的病毒性疾病主要有鸭流感、小鸭病毒性肝炎，鸭瘟（鸭病毒性肠炎）、番鸭细小病毒病等。肉鸭养鸭场应认真落实有关预防措施：
（1）建立严格的卫生清洁与消毒制度。应每日清除肉鸭舍内的粪便、保持清洁干燥，并制定严格的定期消毒制度。严格消毒是预防病毒性疾病发生的有效措施之一。建议在正常生产的鸭场，每周对肉鸭舍内外的地面、粪便、用具等进行全面系统消毒1次；正常进出鸭场的工作人员应在消毒后进入。
(2) 严禁在发生疫情或被怀疑有疫情的场地和水域及其附近区域放养鸭群、引进种鸭或雏鸭、购入鸭产品和饲料产品。
（3）制定科学的免疫程序，严格按照免疫程序接种疫苗。目前，我国饲养的商品肉鸭应严格免疫鸭流感疫苗；肉用种鸭需要免疫鸭流感疫苗、鸭瘟疫苗和小鸭病毒性肝炎疫苗。
