在特禽的疾病中，传染病是最重要的一类。以火鸡、乌骨鸡、珍珠鸡、鹌鹑、肉鸽等特禽传染病较多，常见的有新城疫、禽痘、曲霉菌病、球虫病、黑头病(盲肠肝炎)、鹅口疮(念球菌病)、溃疡性肠炎、霉形体病、衣原体病(鸟疫、鹦鹉热)等。但各类禽的易感性不一，某些疾病在易感禽中的发病情况与鸡较为相似。到目前为止，许多传染病尚无有效的治疗药物，而一部分疫病已有了较好的预防疫苗。因此，在整个饲养管理过程中，除做好日常卫生工作外，还应制订和实施一个科学的免疫程序，其目的在于用最少的人力、物力，收到最理想的免疫效果，以全面提高特禽群抗传染的免疫水平，达到控制和消灭相应的传染病。免疫程序的内容包括疫苗的选择、接种途径、接种时间、接种次数和接种方法等。免疫程序应根据当地的疫病流行情况、雏禽母源抗体水平、前次免疫接种的残余抗体水平、免疫应答能力、采用疫苗类型、疫苗接种方法等实际情况制订。
在特禽的疫病中，使用疫苗预防效果较好的有新城疫和禽痘。现将其免疫程序举例如下：
1．新城疫的免疫程序 预防新城疫的疫苗有鸡新城疫I系、Ⅱ系、Ⅲ系、Ⅳ系苗和油佐剂灭活苗。I系苗毒力较强，多用于2月龄以上的禽，免疫期长达1年以上，接种方法多采用肌注。Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ系苗毒力低，免病期3—4个月，适用各种年龄的禽。现广泛使用的有Ⅱ系和Ⅳ系，接种方法有点眼、滴鼻、饮水、气雾，首次免疫用点眼、滴鼻为佳。目前油佐剂灭活苗已在国内普遍使用。
疫苗接种的具体实施：
(1)鹧鸪 9—12日龄用Ⅱ系或Ⅳ系苗滴鼻或点眼(20倍稀释，每只2滴)，30—40日龄再用Ⅱ系或Ⅳ系苗饮水免疫1次，150日龄左右用I系苗肌注(500倍稀释，每只0．5毫升)。或对150日龄以后的鹧鸪每隔3个月用Ⅱ系苗气雾免疫1次。
(2)鹌鹑 7—10日龄用Ⅱ系或Ⅳ系苗滴鼻或点眼，1月龄时用I系苗饮水免疫，1毫升苗供300—500只幼鹑免疫。
(3)火鸡 用鸡新城疫弱毒苗Ⅱ系或Ⅳ系，7—10日龄第一次免疫，用点眼或滴鼻法，第二次5周龄时饮水免疫，第三次9周龄时饮水免疫，以后每隔3个月免疫1次。每次免疫的间隔时间可通过抗体效价测定来决定。
2．禽痘的免疫程序 禽痘有不同的病毒类型引起，在自然情况下每一型病毒只对同种宿主有易感性，但通过人工感染，也能传给异体宿主。
(1)火鸡 用鸡痘鹑化弱毒冻干苗，100倍稀释，在翼下三角区刺种，6—8周龄和27—28周龄各刺种1次。
(2)鸽 用鸽痘苗毛囊接种，或改良鸽痘苗刺种。常在30—40日龄时接种，高发地区可提前到10日龄左右接种。