加强鸭群的消毒，各个鸭舍之间，尤其是不同日龄的鸭群之间尤其要注意，每星期常规消毒 2 次以上，可以用消毒水饮水消毒，也可以用消毒水喷雾带鸭消毒，可以在很大程度上防止细菌、病毒或者真菌等的大量繁殖，防止呼吸道等各种疾病的发生。 每月或每 2 个月进行彻底消毒一次，清理运动场上的粪便，将鸭舍内潮湿的垫料清理出来干燥用清洁的垫草代替。
常用的消毒剂有季铵盐类、碘制剂、氯制剂、醛类、酚类、醇类、酸类、碱类、离子类等等，要根据消毒剂的种类和特点，在使用过程中进行准确的选择。 不能盲目使用，随意的增加使用浓度和混合使用。为了防止某一种消毒剂产生抗性，都建议每个鸭场准备 2-3 种不同类型的消毒剂，交替使用，效果好！
