1、用土著菌养鸡，不但能处理鸡粪、节省饲料、同时改善鸡的肠道，还对提高鸡的健康大有帮助。
2、养鸡场最怕的是鸡生病。散养鸡喝着清泉，吃着虫子，呼吸着新鲜的空气，生病要少得多，可是散养鸡管理起来很麻烦，而且很多地方没有散养的条件，所以大多数人养鸡还是采取圈养的方式。圈养的鸡虽然好管理了，可是这粪便却是危害鸡群健康的一大元凶。粪便里含有大量的氨气，如果清理不及时，鸡舍里氨气过多，就会诱发鸡的呼吸道疾病。
3、因为土著菌的繁殖速度很快，种群扩大也很快，所以在发酵床上就占据了主导地位，这样一来，有害的微生物就没有挤进来的空间了，即使有，也很少。
4、还有一种让养鸡户头疼的鸡病——球虫病，球虫病主要是通过粪便传染的，寄生虫通过粪便传染。而用土著菌养鸡，发酵床垫料的吸附性很强，能阻止臭味的散发，垫料里更多的土著菌能把鸡粪就地分解，所以鸡场里没有粪坑也没有污水沟，到了夏天，苍蝇、蚊子自然也就少了，就连会导致鸡得球虫病的病菌也少了。
5、每隔二十天或者一个月，喷洒营养液，这样子有益于激活微生物，使它大量繁殖。这样，有害微生物就比较少了。
