造成仔猪腹泻的因素比较繁杂，临床上常混合存在，互为因果。首发往往是非病原性，病原性腹泻多继发于非病原性。腹泻总体可归纳为细菌性性腹泻、病毒性腹泻、寄生虫性腹泻和非病原性腹泻四大类型。
1、细菌性腹泻：大肠杆菌、魏氏梭菌性肠炎、沙门氏菌、猪增生性胃肠炎。其中大肠杆菌引起仔猪黄、白痢。冬季,气温过低,仔猪腹部受寒冷的应激会导致黄、白痢的发病率增高。夏季因高温和高湿有利于大肠杆菌的繁殖而使发病率增大。由沙门氏菌导致的仔猪副伤寒,多因寒冷、气温多变、阴雨连绵而引起。
2、病毒性腹泻：传染性胃肠炎、流行性腹泻、轮状病毒、猪伪狂犬病毒。
3、寄生虫性腹泻：球虫病、蛔虫、鞭虫、结肠小袋纤毛虫。多以
20日龄以上的猪较易发生，一般患猪呈慢性经过。多见仔猪肤色暗淡、被毛粗乱、消瘦、喜卧，粪便有恶臭。
4、非病原性因素：应激(断奶、转群、换料等)、温度(天气骤冷)、低血糖、日粮粗蛋白含量过高、缺乏维生素、矿物质；电解质不平衡等。
临床上可从日龄、腹泻程度判断主要病原：1-2日龄仔猪腹泻大多为大肠杆菌、低血糖和梭菌引起。7日龄后的仔猪腹泻,多由传染性胃肠炎、痢疾、沙门氏菌、轮状病毒引起。10日龄以上各种年龄猪急性、严重的水样腹泻,一般由传染性胃肠炎、流行性腹泻、伪狂犬病引起。
如果是暴发性，传播迅速的腹泻一般为病毒性腹泻；如果是隐性发生，缓慢散播,随时间而加重的腹泻一般为细菌性或寄生虫性腹泻。拉黑色柏油样的粪便多为胃溃疡，可能与粉料太细有关。
