选择购买好疫苗后，疫苗的的运输及保存工作也是非常重要的，处理不当，对疫苗效价损失非常大。
须妥善包装，防止碰破流失。运输途中避免高温和日光直射，应在低温条件下运送。如果外界温度不超过8℃，疫苗可常规运输，当超过8℃时，需冷藏运输。通常大量运输时，使用冷藏车，少量时装入保温箱、盛有冰块的保温饭盒或盛有冰块的广口保温瓶内运送。但对灭活苗在寒冷季节要防止冻结。
购买的疫苗应及时使用，避免长时间存放。若不能及时使用，可按标签说明妥善保存。通常距使用时间不超过2天者，可存放在2℃～15℃阴暗、干燥的环境中，如地窖、冰箱冷藏室；数量很少时，也可保存于盛有冰块的保温饭盒中。需要较长时间保存者，弱毒苗保存于冰箱冷冻室，冻结保存，适宜温度为0℃～20℃，尤其适宜在-15℃以下保存，灭活苗保存于冰箱冷藏室，适宜温度为2℃～8℃。特别注意冻干苗最忌反复冻溶，灭活苗不能冷冻保存，否则，疫苗会失活或降低效价。
