感染性腹泻 细菌性感染：造成子猪腹泻的细菌性疾病病原主要有大肠杆菌、沙门氏菌、魏氏梭菌等，常引发子猪黄（白）痢、副伤寒、猪痢疾及子猪红痢等。病毒性感染：猪传染性胃肠炎、流行性腹泻、轮状病毒病等均会造成子猪腹泻。寄生虫性感染：在临床上引起子猪腹泻的常见寄生虫有猪球虫、鞭虫、蛔虫、结肠小袋纤毛虫等。
营养性腹泻 营养过敏性腹：由于子猪日粮多为玉米—豆粕型饲料，其中有能致子猪过敏反应的抗原物质如大豆球蛋白、半球蛋白等，子猪采食后，易发生超敏反应，引发腹泻。抗营养因子性腹泻：因豆粕中含有胰蛋白酶和脲酶，其中前者可与胰蛋白酶结合成不可逆性的复合物，使胰蛋白酶失去分解蛋白质的作用，导致蛋白质进入大肠后未被消化吸收而腐败发酵引起腹泻。后者把蛋白质的分解产物水解成氨和二氧化碳，使尿素循环中氨浓度增高，损伤肠道黏膜，引发腹泻。营养缺乏性腹泻：猪饲料配比不平衡或猪患慢性消耗性疾病或摄取饲料的量不足等，均可造成猪缺少维生素和矿物质 （铁、硒、叶酸等），从而导致肌体抵抗力下降，出现下痢。
管理性腹泻 母猪管理不当：在母猪产前、产后喂给过多植物蛋白而使乳汁中蛋白质含量过多，致使母猪食欲不振，奶水变性或不注重驱虫工作，致使母猪代谢失调，分泌母乳减少等，均会引发子猪腹泻。子猪管理不当：如果分娩舍阴暗潮湿，会引发子猪应激性腹泻，过度限饲及过度饲喂，也会形成饥饿性和过食性腹泻。
另外，子猪消化道发育不完全，胃酸分泌不足，胃内容物pH值较高，有利于病原菌的生长而不利于消化酶充分发挥作用，从而引发腹泻。消化酶的分泌过少，可导致乳糖、蛋白质消化不完全，也会诱发腹泻。同时由于子猪免疫系统、体温调节系统发育不成熟，抗病力低，而子猪生长发育快，所需营养物质较多，从而使胃肠道消化负担加重，也易引发腹泻。
