土鸡的免疫程序，雏鸡在24小时内必须皮下注射马立克氏病疫苗；7日龄进行鸡新城TV系疫苗和传支疫苗滴鼻或饮水；14日龄皮下注射禽流感疫苗；21日龄时进行鸡传染性囊病弱毒疫苗和鸡新城TV系疫苗的饮水；30日龄翅膀内刺种鸡痘疫苗；35日龄用传染性支气管炎疫苗饮水；45日龄皮下注射禽流感疫苗；60日龄肌肉注射新城疫I系疫苗或灭活疫苗；土蛋鸡在产蛋前2周皮下注射禽流感疫苗和产蛋减少综合征、新城疫、传染性支气管炎等联苗。同时，应根据山地放养土鸡的实际，在15～60日龄中交替使用抗球虫药或中药以防治球虫病；在放养前与放养后的第15～20天和以后每隔一个月应服用驱虫药，防治土鸡线虫病的发生.
