不同临床型病例，其病理变化不尽相同。
（一）急性型 本病的典型病理变化在喉头和气管的前半部。发病初期，喉头气管 黏膜肿胀，充血、出血，甚至坏死，喉头气管可见带血的黏性分泌物或条状血凝块。中后期死亡鸡只喉头气管黏膜附有黄白色纤维素性假膜，并在该处形成栓塞，患鸡多因窒息而死亡。严重时，炎症可扩散到支气管、肺和气囊或眶下窦。内脏器官无特征性病变。后期死亡鸡只常见继发感染的相应病理变化如大肠杆菌病、鸡白痢和鸡慢性呼吸道疾病。
（二）温和型 表现为浆液性结膜炎，结膜充血、水肿，伴发点状出血，眶下窦肿胀以及鼻腔有多量黏液。
组织病理学变化主要见于喉头、气管、结膜的组织病变。特征性组织病理变化为气管上皮细胞混浊肿胀，细胞水肿，纤毛脱落，气管黏膜和黏膜下层可见淋巴细胞、组织细胞和浆细胞浸润，黏膜细胞变性。病毒感染后12h，在气管、喉头黏膜上皮细胞核内可见嗜酸性包涵体，出现临床症状48h内包涵体最多。
