中小规模的养猪生产具有促使猪球虫等微生物大量孳生的条件,如适宜温度,湿度以及高度敏感的宿主群体。这样的环境中,猪等孢球虫会乘机迅速生长，适应这一特殊的猪场环境，最终在猪群内引起发病症。
仔猪球虫病是仔猪断奶前（主要在7~20日龄期间）顽固性下痢最常见的临床症状，许多养殖户对这一疾病还缺乏认识、诊断率低。严重影响断奶仔猪的成活率。
主要表现在：
1．断奶仔猪死亡率增高
2．断奶体重不一
3．平均断奶体重减轻
4．继发感染（细菌感染）导致发病和死亡
5．治疗成本增加（对球虫病和继发感染治疗）
6．清洗污染的猪栏既费工又费时
对球虫进行根除是不可能的，认识到这一点对于防制猪场球虫病极为重要。短期措施或者一次性治疗措施是不能长久解决问题的。养猪业对球虫病的防制比养禽业差的多。
防治球虫病的基本措施：
1. 搞好卫生：清洗、消毒、干燥。
2. 改进管理：实行全进全出制度，适当的饲养密度，控制温度、湿度、保持通风、干燥。
3. 化学预防：投喂抗球虫药（球虫清）
4. 定期更换所用药物：轮换用药，穿梭用药
5. 管理和卫生
要制定出使用的卫生保健方案，必须了解球虫与宿主间的关系。如果仔猪是健康的，其全身处在最佳的免疫状况，且只接触到很低剂量的球虫孢子化卵囊，他们可能感染但不表现腹泻症状。仔猪接触球虫日龄越大，发生球虫病的症状也越轻微。
感染开始自卵囊，而卵囊是前一批仔猪在产房排泄出来的，卵囊可存活于栏内地面和墙壁上。如果要减轻仔猪的感染压力，那么对产房搞好管理，清洗和消毒干燥就极为重要。卵囊对大多数消毒药有很强的抵抗力。清洗，加热（＞70℃），干燥以及使用一些特殊的化学药物，对于减少卵囊数量是最有效的途径。应该同时采用若干种不同的措施，才能减少产房中的感染压力。
应采取的措施：
1. 高压冲洗圈栏，实行全进全出
2. 用火烧圈栏地面和墙壁（以燃气为燃料）
3. 用石灰水撒布圈栏地面
4. 撒布适用的消毒剂（酚类消毒剂）
5. 圈栏完全干燥后进下一批仔猪
6. 要确保产后第一周圈栏清洁干燥
确保较大仔猪排出的卵囊不经过胶靴，扫帚或其他物品带给新生仔猪，并且要防止粪便从圈栏之间的隔板下面流淌到邻圈之中。应该在所有的母猪群内实施适合每一个特定猪场环境的卫生方案；即使这样采取上述所有措施的，非常清洁的猪场也完全有可能发生球虫病。
治疗方法：
1. 磺胺药物主要作用于球虫的有性繁殖阶段，但必须反复用药多次。
2. 仔猪球虫病化学预防和化学治疗的局限性：
3. 仅有几种药物适用或有限适用于仔猪
4. 不可通过饮水和饲料用药
5. 仅有少数几种药获准用于仔猪
6. 重复用药的工作量很大
预防治疗：
1. 在新生仔猪出生后的5--7天口服球虫清1毫升。
2. 在发病阶段可用制菌磺进行治疗每天一次、连续3天。
在免疫接种方面，现在还没有疫苗可用，不可能对仔猪进行抗球虫病的免疫接种。
