为防止可能发生动物传染病等公共卫生问题，中国动物预防控制中心编写了动物疫病防控知识问答一书。有关专家在其中详细介绍动物防疫常用消毒药品及使用方法。专家介绍，除采取清扫、冲刷、洗擦、日晒、焚烧、堆积发酵等物理消毒和生物学消毒方法外，化学消毒应用最为广泛。以下是几种常用消毒药品及使用方法。
（1）石灰水：用新鲜石灰配成的10%至20%的石灰水，可用来消毒场地，粉刷棚圈墙壁等。石灰水的配制方法为：生石灰加4公斤至9公斤水。先将生石灰放在桶内，加少量水使其溶解，然后加足水量。石灰水现配现用，放置时间过长会失效。
（2）草木灰水：适用于对棚圈、用具和器械等的消毒。草木灰水配制方法为：在10公斤水中加2公斤至3公斤的新鲜草木灰，加热煮沸（或用热水浸泡3昼夜），待草木灰水澄清后使用。将草木灰水加热后使用才有显著的消毒效果。
（3）烧碱：2%烧碱溶液可用来消毒棚圈、场地、用具和车辆等。3%至5%的烧碱溶液可消毒被炭疽芽孢污染的地面。消毒棚圈时，将家畜赶（牵）出栏圈，经半天时间，将消毒过的饲槽、水槽、水泥地或木板地用水冲洗后，再让家畜进圈。
（4）过氧乙酸：2%至5%的过氧乙酸溶液，可喷雾消毒棚圈、场地、墙壁、用具、车船、粪便等。
（5）复合酚：复合酚100 倍至 300倍液适用于消毒畜舍、场地、污物等。
（6）百毒杀：用百毒杀3000倍稀释液喷洒、冲洗、浸渍，可用来消毒畜舍、机械、器具等。百毒杀2000倍稀释液可用于紧急预防畜舍的消毒。百毒杀10000 倍至 20000倍稀释液可用于储水塔、饮水器消毒，可以杀死微生物、除藻、除臭、改善水质。
此外，可选用蓝光A+B、灭毒杀等药品，按说明书要求配制后对环境、器械等进行消毒。