一、加强种禽的饲养管理，提高种蛋的内在质量
根据种禽营养需要的特点，合理配制日粮，注意防止饲料加工、贮存过程中营养因子的损失和饲料的霉变，确保种禽获得足够的营养，特别应注意添加维生素和矿物质，同时必须加强饲养，饲喂全价饲料，减少各种应激因素，促进种禽对营养物质的利用和转化。另外，应提高种禽的遗传育种水平，预防遗传性胚胎病的发生。
二、 做好种禽的防疫卫生工作，减少内源性胚胎传染病的发生
做好种禽的防疫卫生工作，杜绝大的传染病的发生，净化种鸡群，特别建立无白痢、无霉形体的鸡群。禁止用急性疾病痊愈不久或有慢性传染病的家禽所产蛋进行孵化。
三、 做好种蛋的卫生消毒工作，减少外源性胚胎传染病的发生
在集蛋、运输、贮存和孵化过程中做好清洁、消毒工作，避免蛋壳污染。产蛋箱必须保持清洁干燥，增加每天的集蛋次数，严重污染的蛋不作孵化用。收集起来的种蛋应及时消毒、贮蛋库必须清洁、温湿度适宜、通风透气良好。种蛋在入孵前必须再严格消毒，孵化厂的场地，孵化设备和工具必须清洁，做到批批消毒。另外，还可以用抗生素采取特殊方法对种蛋进行处理，杀灭种蛋内部的病原微生物，如败血霉形体。
四、 提高孵化技术
采取必要措施，严格按照孵化要求进行孵化。
