做好禽流感疫病的防治工作，养殖场的日常消毒尤为重要。饲养场管理者要依照HACCP（危害分析与关键控制点）的原则制定科学的消毒操作规范。危害分析即确认由接受到运输过程中每一步骤可能发生的微生物污染和物理风险；关键控制点即消除微生物风险的行动细节及应用的消毒剂；整个消毒操作过程必须特别注意个人卫生，工作人员必须穿戴防护性衣物，手部消毒，足履浸池消毒，进出鸡舍或孵化室时尽可能进行淋浴。
制定出消毒操作规范后，要确保每一个环节都按照消毒操作规范执行，加强消毒措施的落实尤为关键。
推荐消毒药为：生产场区用2%～3%烧碱+0.1%季胺盐。该配方可提高10倍的杀毒、杀菌能力；鸡舍门口消毒池用1∶400二氧化氯消毒液；带鸡消毒用0.1%～0.2%过氧乙酸或1∶400有机氯，每天1～2次，交替使用。粪便消毒用0.2%～0.5%过氧乙酸（可以是甲或乙液混合）+1∶200有机氯，过氧乙酸同时有降低舍内氨气的作用；用碘制剂消毒也有效。
空舍用福尔马林熏蒸消毒效果最好，一般用于进鸡前的空鸡舍、孵化厅与鸡舍操作间的熏蒸消毒和环境喷洒消毒。鸡场门口要设消毒池，严禁外人进入禽舍。工作人员出入要更换消毒过的胶靴、工作服；用具、器材、车辆要定时消毒。粪便、垫料及各种污物要集中作无害化处理；消灭禽场的蝇蛆、老鼠、野鸟等各种传播媒介。
建立严格的检疫制度，种蛋、雏禽等产品的调入要经过兽医检疫；新进的雏鸡应隔离饲养一定时间，确定无病者方可入群饲养；严禁从疫区或可疑地区进鸡及其制品。
