霉菌在饲料及原料中生长，除产生有毒的代谢产物霉菌素外，还有以下危害。
1、 破坏饲料营养成分霉变使饲料营养成分数量减少，质量下降。饲料中粗脂肪减少，纯蛋白质减少，而氨态氮增加，氨基酸含量下降，降低了蛋白质的可消化利用性；引起饲料VB1、VD、VB2、泛酸减少和VE被破坏。
2、 霉变释放热量，饲料及原料温度升高，易引起其它细菌的污染和侵害。影响饲料的贮存和使用。
3、 饲料适口性降低。
饲料被霉菌污染后，会散发一种特殊的“霉臭”味，使饲料的适口性降低，导致畜禽采食下降，甚至绝食。
