一、基因工程疫苗
1.重组活载体疫苗。病毒活载体疫苗的研究较多，如用鸡痘病毒作为载体，表达成功的保护性抗原基因就有新城疫病毒、传染性法氏囊病病毒、马立克氏病病毒、禽网状内皮组织增生症病毒、狂犬病病毒、传染性支气管炎病毒、艾美尔球虫等。2005年12月24日，农业部在北京宣布，我国已成功研制出禽流感———新城疫重组二联活疫苗，并正式批准生产。
2.基因工程亚单位疫苗。已经制成并用于生产的主要有口蹄疫基因工程亚单位疫苗、鸡传染性法氏囊病基因工程亚单位疫苗，用于预防仔猪和犊牛下痢的大肠杆菌菌毛基因工程重组亚单位疫苗。
3.基因缺失疫苗。目前已有多种基因缺失疫苗问世，如伪狂犬病基因缺失疫苗、霍乱弧菌基因缺失疫苗、大肠杆菌基因缺失疫苗等。
二、核酸疫苗
现已研制成功的主要有猪繁殖与呼吸综合征核酸疫苗。在病毒性传染病方面的研究成果，有牛疱疹病毒、牛病毒性腹泻病毒、猪瘟病毒、口蹄疫病毒、轮状病毒、禽流感病毒、伪狂犬病病毒、狂犬病病毒；在细菌性传染病方面，有结核杆菌、肺炎球菌、破伤风杆菌、布鲁氏菌、肺炎霉形体；在寄生虫病方面，有囊虫、血吸虫、球虫、绦虫、锥虫、弓形虫和隐孢子虫。
三、合成多肽疫苗
目前研究较多的有口蹄疫病毒、犬细小病毒、狂犬病病毒、流感病毒等。因为制造成本较高，合成多肽疫苗投放市场的不多。
四、抗独特型抗体疫苗
目前针对乙型肝炎病毒、狂犬病病毒、新城疫病毒等抗独特型抗体的研究较为活跃，但因其使用技术还不成熟，故临床应用尚需时日。
五、病毒———抗体复合物疫苗
这类疫苗含有病毒和抗体两种成分，虽然作用机制和方式还不太清楚，但免疫确实可靠，且安全性好。这类疫苗曾经使用的有猪瘟病毒—抗体复合物疫苗、牛病毒性腹泻病毒—抗体复合物疫苗、传染性法氏囊病毒—抗体复合物疫苗，用于猪瘟、牛病毒性腹泻、鸡法氏囊病的免疫。
六、转基因植物疫苗
转基因植物疫苗使用了高等植物作为载体，如黄瓜、胡萝卜、番茄、玉米、大豆等。已成功表达的抗原有大肠杆菌热不稳定毒素B亚单位、霍乱弧菌肠毒素B亚单位、乙型肝炎表面抗原、兔出血热病毒VP60蛋白、口蹄疫VP1蛋白、传染性胃肠炎病毒S蛋白、狂犬病病毒G蛋白等。这类疫苗的效果好、成本低，疫苗的植物载体易于保存、使用方便，市场潜力巨大，发展前景十分广阔。
七、T细胞疫苗
用T细胞进行疫苗接种，这在动物实验中取得了较理想的免疫效应。这类疫苗属于多肽疫苗，在治疗自身免疫性疾病和抗移植排斥反应中有独特的优越性。
