六味地黄丸处方为：熟地黄160g，山茱萸（制）80g，牡丹皮60g，山药80g，茯苓60g，泽泻60g。2005版《中国药典》采用高效液相色谱法测定了山茱萸中马钱苷和牡丹皮中丹皮酚的含量。有关六味地黄丸制剂的含量测定方法总结如下。
一、2005《中国药典》六味地黄丸含量测定项下：
山茱萸：
色谱条件与系统适用性试验：以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂；以四氢呋喃-乙腈-甲醇-0.05%磷酸溶液（1：8：4：87）为流动相；检测波长为236nm，柱温40℃。理论板数按马钱苷峰计应不低于4000。
供试品溶液的制备：取本品水蜜丸或小蜜丸，切碎，取约0.7g，精密称定；或取重量差异检查项下的大蜜丸，剪碎，取约0.1g，精密称定，置具塞锥形瓶中，精密加入50%甲醇25ml，密塞，称定重量，超声提取（功率250W ，频率33kH Z）15分钟，放冷，再称定重量，用50%甲醇补足减失的重量，摇匀，滤过。精密量取续滤液10ml，置中性氧化铝柱（100～200目，4g，内径1cm，干法装柱）上，用40%甲醇适量使溶解，并转移至10ml量瓶中，加50%甲醇稀释至刻度，摇匀，即得。
牡丹皮
色谱条件与系统适用性试验：以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂；以甲醇-水（70：30）为流动相；检测波长为274nm。理论板数按丹皮酚峰计应不低于3500。
供试品溶液的制备：取本品水蜜丸或小蜜丸，切碎，取约0.3g，精密称定；或取重量差异检查项下的大蜜丸，剪碎，取约0.4g，精密称定，置具塞锥形瓶中，精密加入50%甲醇50ml，密塞，称定重量，超声提取（功率250W ，频率33kH Z）45分钟，放冷，再称定重量，用50%甲醇补足减失的重量，摇匀，滤过，取续滤液，即得。
二、以单皮酚为指标
李玮玲等采用SPE-HPLC法测定六味地黄丸中丹皮酚的含量。高效液相色谱仪为Waters 2695；色谱柱为Hypersil ODS(2)柱（205mm×4.6mm, 5μm）；流动相为甲醇-2%冰醋酸（55：45）；流速为1.0mL/min；检测波长为275nm；柱温25℃。样品用甲醇超声提取后经Sep-Pak C18微柱处理，收集第12～14mL流出液。
仲英等采用薄层扫描测定了六味地黄丸中丹皮酚的含量，采用日本岛津CS- 910 双波长薄层扫描仪。层析条件：硅胶G板；展开溶剂：环乙烷-氯仿-无水乙醇(7：3：1)。薄层扫描条件：反射法锯齿扫描，波长λs=274nm,λR= 365nm；扫描速度20mm/min；狭缝1.25×1.25mm；Sx=3。样品用无水乙醇回流提取。
汪显阳等用差示光谱法测定六味地黄丸中丹皮酚的含量，采用岛津UV 2240 分光光度计, 751G 分光光度计。样品用乙醇浸出提取, 缺丹皮酚样品为空白样品。以蒸馏水和0.01mol/L氢氧化钠溶液分别定容,选择352nm为测定波长,370nm为参比波长。
赵新峰等用胶束电动毛细管色谱法分离测定中药材牡丹皮及中成药六味地黄丸中丹皮酚的含量。定量采用内标法,选取芦丁为内标。Unimicro 毛细管电泳仪(美国Hyperquan.Inc 公司)。所用毛细管规格为55cm(有效长度50cm)×75μm,检测波长274nm,电压15 kV ,背景电解质分别为30mmol/L SDS-30 mmol/ L硼砂,20mmol/ LSDS-50mmol/ L硼砂(pH9.4)。供试品溶液的配制：牡丹皮药材加95%乙醇超声提取；六味地黄丸粉碎后,与5g硅藻土(色谱载体,40～60目)混研,研匀,烘干,无水乙醇超声提取。
宋丽丽等用近红外光谱法测定六味地黄丸中丹皮酚， 分别采用偏最小二乘(PLS)、主成分分析-BP神经网络、小波变换-BP神经网络对所采集的样本数据进行处理。
完茂林等测定六味地黄丸中丹皮酚的含量，采用毛细管气相色谱法,以正十六烷为内标。日本岛津GC-9A气相色谱仪；色谱柱为熔融弹性毛细管柱(28m×0. 28mm ,5μm),涂布SE-30 0.26μm, N2 流速60ml/min, H2流速50ml/min,空气流速500ml/min,柱温180℃,汽化器、检测器320℃。样品制备：六味地黄丸研细用乙醇超声处理后用中性氧化铝柱(100～200 目,10 g,φ11mm)处理，收集乙醇洗脱液，浓缩并定容。
三、以齐墩果酸或熊果酸为指标
冯燕芹等测定六味地黄丸（浓缩丸）中熊果酸的含量，采用HPLC法。色谱柱为ALLTIMA C18 5μ；流动相为甲醇-水（80：20）；流速为0.5mL/min；ELSD检测器漂移管温度：80℃。样品用乙醚回流提取。
丁晴等测定六味地黄丸及六味地黄胶囊中齐墩果酸、熊果酸的含量，采用HPLC法。高效液相色谱仪为岛津LC-10AD；色谱柱为Shim-Pack C18分析柱(4.6mm×150mm,5μm)；流动相为乙腈-甲醇-水-乙酸胺( 70：16：14：0.5)；流速1mL/min；检测波长215nm；柱温为室温。样品处理方法：六味地黄丸（浓缩丸）用水溶解并过滤后，用乙醚加热回流提取，残渣用石油醚（30～60℃）浸泡，弃去石油醚液，残渣用甲醇溶解并定容。
四、以马钱素为指标
陈贺新等测定六味地黄丸中马钱素的含量，采用RP-HPLC法。高效液相色谱仪为Waters 510；色谱柱为YWG-C18柱（150mm×4.6mm,5μm）；流动相为甲醇-水（1：4）；流速为0.8mL/min；检测波长为238nm。样品用甲醇超声提取。
五、多糖、梓醇等
汪显阳等采用苯酚硫酸法测定了六味地黄丸中多糖的含量。供试品溶液的制备：精密称取1g六味地黄丸粉末，加80%乙醇加热回流提取，过滤，残渣用80%热乙醇洗涤，再用蒸馏水洗涤，热蒸馏水洗涤，合并水滤液用蒸馏水定容。
刘长河等用薄层扫描法测定了六味地黄丸中梓醇的含量，薄层条件：硅胶G板，展开剂为氯仿-甲醇-水（7：3：0.5）；碘蒸汽显色。薄层扫描条件：单波长反射锯齿扫描，扫描波长为350nm，狭缝1.2mm×1.2mm，Sx=3。
六味地黄丸用80%乙醇超声处理后，经D101型大孔吸附树脂纯化：先以水50ml洗脱，弃去；以20%甲醇50ml洗脱，合并洗脱液，浓缩并定容。
赵新峰等测定中药材山茱萸及中成药六味地黄丸中没食子酸的含量，采用毛细管区带电泳法，选取肉桂酸为内标。所用毛细管规格为60cm(有效长度45cm)×75μm,检测波长271nm ,电压20kV,背景电解质为20mmol/ L硼砂，重力进样(10cm×5s)，电泳温度20℃,每次运行前依次用0.1mol/ LNaOH溶液、去离子水、电泳缓冲溶液冲洗3min。六味地黄丸用95%乙醇超声处理。