胡黄连本品为玄参科植物胡黄连Picrorhiza scrophulariiflora Pennell的干燥根茎。2005版《中国药典》一部采用高效液相色谱法，以胡黄连苷I、Ⅱ为指标，测定其含量。文献报道的方法较少，一般为高效液相色谱法。
2005版《中国药典》胡黄连含量测定项下：
色谱条件与系统适用性试验：以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂；以甲醇-水-磷酸（35：65：0.1）为流动相，检测波长为275nm；理论板数按胡黄连苷Ⅱ峰计算应不低于4000。
供试品溶液的制备：取本品粉末（过三号筛）约0.1克，精密称定，置具塞锥形瓶中，精密加入甲醇50ml，密塞，称定重量，超声处理（功率250W，频率33kHz）30分钟，放冷，再称定重量，用甲醇补足减失的重量，摇匀，滤过，精密量取续滤液1ml，置5ml量瓶中，加甲醇至刻度，摇匀，即得。
王菁等利用高效液相色谱法建立了测定胡黄连药材中胡黄连甙-Ⅱ的测定方法,并用该方法比较了印度胡黄连和西藏胡黄连中胡黄连甙-Ⅱ的含量差别。采用LC-10A液相色谱仪(日本岛津制作所)，色谱柱为C18柱(4.6mm×150mm，大连化物所)；柱温26℃；流动相为乙腈-水-冰醋酸(25：75：0.5)；检测波长266nm；流速0.8ml/min；灵敏度0.08AUFS。胡黄连药材用95%乙醇放置过夜后再超声提取30min。张朝晖等比较同科属植物印度胡黄连和西藏胡黄连中的主要有效成分胡黄连甙-Ⅱ的含量差别时也采用此方法。
另外，吕晶等测定胡黄连苷-I血浆浓度的RP-HPLC法时，乙腈-水(20∶80) 为流动相。
