近年来，“生态农业”、“立体养殖”在农村各地成为较为时髦的名词。有些地方率先推广了先用精料喂鸡，再用鸡粪喂猪，然后用猪粪喂鱼（或喂鸭）等一种或多种畜禽粪便喂另一种畜禽的养殖模式，并被作为发展生态农业和立体养殖的经验广泛加以推广。
但一些畜禽养殖权威专家指出，畜禽粪便虽然含有一定量的营养物质，但其成分较为复杂。普遍含有吲哚、胺类、尿酸、尿素、亚硝酸盐、寄生虫及其虫卵等，还含有一些有害病源微生物及畜禽代谢所排泄的毒素物质等，极易造成畜禽间疾病交叉感染和导致某些畜禽传染病的传播和流行。
随着消费水平的提高，人们对畜禽肉类的品质要求越来越高，越来越崇尚绿色肉类食品。“安全肉”工程不仅要求畜禽无疾病，而且要求确保畜禽肉类的激素含量、药物残留量等有损人类健康的物质含量不能超标。如果直接用畜禽粪便喂畜禽，一方面由于其特殊的气味和较差的适口性，饲喂效果未必理想；另一方面势必导致畜禽间疾病的交叉感染，甚至导致某些有害物质在畜禽体内的残留量超标。因此，推行“立体养殖”，必须严格掌握其使用方法和严格控制使用量，并遵循如下饲喂原则：一是畜禽的粪便必须经过严格的密封发酵处理或高温处理，严禁直接用畜禽的粪便喂畜禽，且喂量不可超过总饲喂量的40％；二是使用发酵或高温处理过的畜禽粪便喂畜禽，应在其饲料中添加一定量的抗生素类药物或抗生素类添加剂，抑制一些有害病源微生物的生长繁殖，确保饲料安全；三是保持有充足的青绿多汁饲料供应，同时要建立定期驱虫制度；四是畜禽出栏前至少半月内应停止饲喂粪便，谨防有害物质在畜禽体内残留。
