中药的化学指纹图谱是指采用一定的分析技术，得到的能够标示中药内含复杂物质群的各化学成分特性的色谱或光谱图，当然也可以是其他指纹图谱。指纹图谱的基本属性是“整体性”和“模糊性”，整体性是指将指纹图谱视作一个整体，通过辨认其综合特征来分析和比较；模糊行是指对指纹图谱的分析和比较强调的是相似性，而不是完全相同，这更符合中药的自然属性。因此，中药化学指纹图谱可以定义为是一种客观综合分析的整体性质量控制方法。借以可鉴别中药的真伪优劣，评价中药原料、半成品和成品质量的均一性和稳定性。
若是更深层次的研究，按中医药的特点，可深化发展成为中医药的谱效学。即不同的中药（单方或复方），有不同特征的指纹图谱，通过图谱特征与药效的对比研究，得到建立在该特征的指纹图谱基础上的药效关系结果，即构成了新的谱效学。与化学药品的构效关系一样，特征图谱的改变，必然引起药效的改变，这是用现代分析方法对传统中医药进行的数字化革命。
中医药如果能从固定处方药味保证疗效发展为通过谱效关系控制疗效，等于给世界扑出了一条认知和接受中医药的轨道，等于在进行真正意义上的中医药国际接轨。 综上所述，中药化学指纹图谱技术是中药质量控制的关键技术，是当前最符合中药特色的评价中药真实性、稳定性、一致性和有效性的可行方法。
2005年版中国药典将增加的质量标准模式是化学指纹图谱配合有效成分的含量测定和必要的检查项目，较全面的整体控制中药的质量。我们将努力探索，逐渐建立完善符合中医药理论具有中医药特色的中药质量标准控制体系。
