1、浸洗法：在一定容器内，配制高浓度的药物，用较短的时间，浸洗鱼体，从而达到杀灭鱼类身体或鳃上病原体的目的。使用这种方法，若是寄生虫病，往往浸洗1～2次即可奏效。若是传染性鱼病，需要浸洗多次方能彻底治愈，且第2次浸洗与第1次中间应隔1～2天。
2、内服法：常用于增加营养，病后恢复及体内病原生物感染，特别是细菌性肠炎病和寄生肠虫病，一般是配制成药饵投喂。
3、遍洒法：使用这种方法治疗寄生虫性鱼病，通常泼洒1次即可奏效。而传染性鱼病，则需经5～10天，再用1～2次药方可。
4、注射法：此法主要防治一些传染性鱼病，分为腹腔注射和肌肉注射2种。腹腔注射是将针头沿腹鳍基部插入，注射深度为0.2～0.5厘米，以不伤及内脏为准。较大的鱼体才可在肌肉部位注射，通常是背鳍基部的无鳞区，注射法只限于全长6.6厘米以上的鱼体。
5、涂抹法：此法主要用于外伤或局部炎症的防治。通常用高浓度药物涂抹伤处或病灶。棉球或毛笔蘸取药物涂抹，为避免药液流到鳃上，要将鱼头朝上，尾向下，从前往后涂抹。多次涂抹时，每次涂抹时间应间隔1天。
6、悬挂法：用于流行病季节来到之前的预防或病情轻时采用，具有用药量少、成本低、方法简便和毒副作用小等特点，但杀灭病原体不彻底，只有当鱼、虾游到挂袋食场吃食及活动时，才有可能起到一定作用。目前常用的悬挂药物有含氯消毒剂、硫酸铜等。
