仔猪刚出生时，其肠道是无菌的, 但出生后很快就有肠道细菌定植，其中也包括一些肠道致病菌在内，而初乳中所含的母源抗体可以防止这些细菌对肠道的损伤，所以初乳摄取不足的仔猪往往可能会患上新生仔猪腹泻病。
一、可能感染的病原
大肠杆菌是最早定植的细菌之一，致病性大肠杆菌菌株通过菌毛黏附素（通常是F4或F5菌毛）粘附在小肠上皮细胞上, 然后通过分泌肠毒素（通常是热稳定毒素和热敏感毒素）,导致肠上皮细胞中的氯离子析出,同时分泌大量液体，最终导致腹泻。对于新生仔猪而言，腹泻导致体液流失对机体伤害尤为巨大,不仅因为水占其体重的大部分,而且由于早期仔猪体内水分的唯一的来源只有母猪的乳汁。
而后在仔猪肠道内定植的细菌是产气荚膜梭菌A型和C型, 可能还有梭状芽孢杆菌，然后可能是轮状病毒、传染性胃肠炎或猪流行性腹泻病毒或球虫等, 它们在小肠上皮细胞中繁殖, 破坏吸收细胞, 导致肠壁萎缩, 进而引起腹泻。
二、传染途径
通常情况下，猪场发生新生仔猪腹泻的传染源包括病猪、污染的环境以及母猪粪便，尽管成年猪免疫系统成熟，不再因感染球虫、轮状病毒、大肠杆菌和梭菌感染而发病，但这些病原都有可能单独或混合存在于母猪粪便中。同一个栋舍或产房中仔猪之间的传播是最常见的,当然如果栋舍或产房内没有有效的清洁措施，类似大肠杆菌或者梭菌可以在这种环境下存活数月，仔猪极有可能通过污染的环境感染病原而致发病。除此之外，从场外引进种猪等也可能同时引入新的致病病原。
三、临床症状
新生仔猪腹泻通常发生于0-4日龄的仔猪,并且出生后12小时内即可发病，患病仔猪虽然也会吸吮母乳,但往往呈现尾巴无力、下垂,被毛紊乱、精神沉郁、消瘦等症状，如出现脱水，则仔猪会出现眼睛凹陷,臀部和脊椎突出等症状。此外，腹泻产生的粪便可能附着于仔猪体表，致使其体表污浊，发病严重时，仔猪可能昏迷或死亡,即便腹泻恢复,患病猪仍表现消瘦和发育迟缓。如果是梭菌感染,患病仔猪往往在出生36-48小时内发生血痢，拉血红色稀便。
连续式生产的猪群，因产房清空时间短，往往不能充分清洁消毒，暴发该病的几率更高，其死亡率也可高达70%以上，而后随着日龄的增加，腹泻死亡率迅速降低，至14日龄死亡率可降至10%以下。
生产中确认是否存在新生仔猪腹泻比较简单，一般通过日常对产房的巡查即可，比如脱水消瘦的仔猪就经常伴有腹泻，但有时可能需要逐个检查病情, 以确认是否是初产母猪病例或经产母猪中的早期病例。腹泻的仔猪直肠温度通常是正常的, 可以用棉签轻微插入直肠，采集肛门拭子送至实验室进行检测以确诊。
需要注意的是，新生仔猪腹泻所带来的危害不仅仅只在仔猪，仔猪因患病而导致母乳摄入量降低或者死亡时，母猪乳头被吸吮的频率减少, 可能还会导致母猪哺乳后期或以后胎次中出现无乳症甚至是乳房炎的疾病,从而导致更大的生产问题和经济损失。
目前而言，新生仔猪腹泻的病原很难确认，实验室检测通常需要采集刚刚下痢仔猪的新鲜样品，或急性死亡病例仔猪的肠道内容物进行检测，并且检出的病原是多样的，通常情况下是产肠毒素大肠杆菌产生的F5、F6等菌毛黏附素, 或产气荚膜梭菌A型或C型,或梭状芽孢杆菌, 后期也可能感染轮状病毒、球虫，传染性胃肠炎或流行性腹泻病毒也可能参与其中。
四、病理剖检
对脱水病例的剖检病变检查可见肝脏暗红，胃部有凝乳或乳凝块，小肠和大肠膨胀，松弛并充满液体。如病原以大肠杆菌为主，则剖检可能观察不到，或只有轻中度肠道暗红，而以产气荚膜梭菌C型为主要病原时，肠道内会有明显的血水，梭状芽孢杆菌为主要病原时，剖检呈现肠系膜水肿、肠道壁增厚等症状。
五、治疗及预防
新生仔猪腹泻是多因素疾病，针对单一病因的治疗措施如口服抗生素可能无效，加上近年来肠道致病菌的耐药性增强等因素，采用传统的药物保健等措施进行预防，很可能出现病情的加重或反复。而通过母猪接种疫苗并确保仔猪摄取足量初乳, 是预防新生仔猪腹泻的有效方法，尤其是针对以细菌性病原为主的新生仔猪腹泻，一些基因工程疫苗含有针对不同致病菌株的主要抗原如菌毛黏附素或肠毒素等，对不同致病血清型具有交叉保护作用。除此之外，良好的产房管理措施，如全进全出的管理模式,批次化管理中的卫生消毒措施以及产房良好的保温措施等等，均会影响新生仔猪腹泻的防治的效果
