预防和控制疾病发生、传播和蔓延的最好的办法----消毒。对于养鸡业来说亦如此，只有在饲养中的各环节上制定和采取一整套严密的消毒措施，才能有效地消灭散播于环境、鸡体表面及饲养工具上的致病微生物，保证所饲养的鸡群健康成长，发挥出最好的生产性能。
这里仅就鸡舍的消毒步骤按顺序介绍如下：
1、清扫：将鸡舍内各个角落的粪便、垫料、杂物、灰尘等清扫干净，不留死角。此过程可以清除80%的微生物。
2、冲洗：对鸡舍内部所有地方如地面、墙壁、顶棚、笼具及鸡舍内用品一律冲洗干净。此过程可以清除10%的微生物。
3、药物喷洒，先用2-3%火碱水溶液对鸡舍内部进行彻底喷洒消毒，间隔1小时后，再用碘、氯制剂、醛类、季铵盐类等消毒剂按合理比例配比对鸡舍再行消毒一遍。此过程可以消灭5%的微生物。
4、熏蒸消毒：使用福尔马林+高锰酸钾混合对鸡舍实施熏蒸消毒，熏蒸方法：
1)使用剂量：每立方米需要福尔马林40ml+高锰酸钾20克;
2)温度要求：10℃以上;
3)湿度要求：50-70%;
4)密闭时间：不低于24小时。
此过程可以消灭3%的微生物。
5、空舍：空舍是一个很重要的消毒步骤，它可以中断微生物的生活史，一般空舍时间为7-15天为宜。此过程可以消灭2%的微生物。
