过去三十多年，我国生猪养殖业已经发生了显著的变化，其趋势是规模化程度不断上升，各种养殖模式不断出现，尤其以“公司＋农户”、上下游整合等取得了非常好的市场评价。此外，不断增加猪群在不同地区和国家之间的流动和贸易，包括合法的引种和非法走私等。而这些都为猪群疾病的预防与控制带来了挑战。另外一方面，已知的猪病病原不断变化，新的病原陆续出现。
下面简单介绍两种新发疫情。
1 塞尼卡病毒病
该病毒病新近才在国内发现，很可能是由引种从国外引入我国。具有和口蹄疫非常类似的症状，而没有相应的疫苗来防疫，存在着逐渐传开的风险。
2002年首次在的PER.C6细胞系中被偶然发现，并被命名 为SVV-001。1988年至2001年从美国收集的猪样本中分离到许多SVV分离株，但临床症状与这些分离株（如果有的话）的联系没有被很好地阐明。
加拿大和美国分别在2007和2010年，从水疱病的猪样品中鉴定出SVV。 但这些案例是散发的，所以一直没有引起大家的重视。然而到了2014年和2015年，在巴西和美国发现育肥猪、种猪中的水疱病暴发以及新生仔猪死亡，诊断得知可以排除已知引起水疱病变的病原体，但是从这些暴发场中一直能检测到SVV。也就是说，很可能塞尼卡病毒就是这些病症的病原体。
最近在我国发现的分离株（当代分离株）与1988-2001年在美国分离到的SVV-001分离株和其他分离株遗传上有差异。在我国的水疱病的鉴别诊断中应考虑SVV的作用，并采取相应的措施，以免引起该病的大规模传播。
2 猪冠状病毒病
目前已经确认五种猪冠状病毒—Alpha-冠状病毒属：猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪呼吸道冠状病毒（PRCV）和猪流行性腹泻病毒（PEDV）； Beta-冠状病毒属：猪血凝性脑脊髓炎病毒（pHEV）； Delta-冠状病毒属：猪 delta-冠状病毒(PDCoV)。
大家比较熟悉的是引发近几年猪腹泻的PEDV和TGEV，它们都属于Alpha 冠状病毒属。同在这个病毒属的PRCV与TGEV之间存在交叉保护。而PEDV 和 PDCoV 感染对全球养猪业的发展提出严重挑战。Beta和Delta-冠状病毒在国内则很少听闻。
防控猪流行性腹泻病毒需要多管齐下。两个重要的方面是：1）公共卫生和生物安全；2）诱导保护性免疫力。免疫后备母猪和经产母猪，诱导产生的母源抗体（包括IgA和IgG）免疫力对保护脆弱的新生仔猪非常关键，使其获得被动免疫保护。在亚洲国家，一些基于传统PED毒株开发的灭活和弱毒疫苗已经使用，但并不能够完全保护猪群抵抗新发变异高毒力PED的毒株。在我国和韩国，基于新毒株开发的灭活疫苗已经开始应用。在交叉保护性能上将大大优于传统毒株的疫苗产品。
PDCoV 首先在2009年香港收集的猪样品中被发现。随后 ，在美国、韩国、中国大陆、泰国和老挝被相继发现 。而早在 2004 年 10 月，在安徽的猪腹泻样品中就已检测到 PDCoV RNA。实验研究证实，在普通和无菌猪机体内， PDCoV 属于肠致病性病原，但临床影响和疾病严重程度远远小于高致病的猪流行性腹泻病毒。
