对卡他性胃肠炎，应治标和治本相结合，根据表现的不同主证，确定证候，辨别寒热虚实，采用开胃、健脾、消食、导滞、止泻和利湿的综合治疗方法。
当患畜表现食欲减少，形寒肢冷，耳鼻俱凉，口流清涎，大便粗汤，口舌淡白或青黄，舌津滑利，苔薄白，脉沉迟时，治宜温中散寒，健脾开胃。方用桂心散（桂心、青皮、益智仁、白术、厚朴、干姜、当归、陈皮、砂仁、五味子、肉豆蔻、炙甘草）加减。
当患处表现精神倦怠，头低耳耷，草料减少或废绝，大便干燥，小便短赤，口色鲜红，舌津干燥，舌苔厚黄，口有臭味，脉象洪数时，治宜清胃降火，滋阴润燥。方用芩连石膏汤（黄芩、连翘、生石膏、花粉、麦冬、玉竹、玄参、知母、川军、地骨皮、甘草、建曲、陈皮）加减。
当患畜表现精神困倦，常打哈欠，水草减少或废绝，有时吃草不吃料，站立呆痴，不愿行走，肚腹胀满，嗳气酸臭，口舌红燥，舌苔厚腻，脉象洪大时，治宜消食导滞。用保和汤（山楂、六曲、半夏、茯苓、陈皮、连翘、莱菔子）加减或消滞汤（炒山楂、麦芽、六曲、莱菔子、大黄、芒硝）加减。
若患畜表现精神倦怠，能吃不上膘，大便稀软，有时粪球紧小，常带有消化不全的饲料渣，口色蛋白或青黄，脉象沉细。治宜健脾益气。方用益气健脾散（党参、白术、茯苓、甘草、薏苡仁、砂仁、黄芪、陈皮、炒山药、炒扁豆、鸡内金、干姜）加减。
对冷肠泄泻，粪清如水，肠鸣如雷，形寒肢冷，耳鼻俱凉的患畜，治宜温中散寒，利水止泻。方用胃苓散（苍术、厚朴、陈皮、猪苓、泽泻、白术、桂枝、茯苓、甘草、干姜、茴香）加减。
对发病缓慢，病程较长，身形渐瘦，毛焦肷吊，腹内肠鸣，不时作泻，粪不成球，粪渣粗糙，完谷不化，日久脾肾两虚，久泻不止者，治宜健脾燥湿，利水止泻。方用参苓白术散（党参、白术、白茯苓、甘草、山药、白扁豆、莲子肉、薏苡仁、缩砂仁、桔梗）加减。
