羊传染性脓疮口炎与羊痘及溃疡性皮炎有明显区别，羊痘有明显的体温变化，在四肢内侧和体表其他皮肤较薄的部位可见到痘疹的发展过程；溃疡性皮炎表现为组织破坏，以溃疡为主，不形成疣状痂。
治疗方案一先用0.2%高锰酸钾溶液冲洗，待痂垢软化后剥去，再用3%双氧水清洗，最后用煮沸过的温水加冰片配成8%溶液擦洗，洗净后涂上冰硼散，每日2次；肌注聚肌胞（聚肌苷酸)每只2毫升，隔一天再用1次；体温升高的病羊肌肉注射青霉素钾每只160万单位，每日2次，连用3天；不能采食的病羊用50%葡萄糖30毫升，5%葡萄糖500毫升静注，每日2次。
治疗方案二病毒唑每毫升100毫克、地塞米松注射夜每毫升5毫克，按2:1混合肌注，成年羊3毫升，并用紫药水涂擦患处，一般感染2～3天可治愈。
重症者用镊子去掉痂皮、脓疱皮，用洁尔阴清洗创面，将冰硼散粉末（冰片50克、硼砂500克、元明粉500克、朱砂30克，研末，混匀)兑水调成糊状，涂抹患部，隔日一次，至患部痂皮或结痂脱落，效果十分明显。
治疗方案三首先隔离病羊，对圈舍、运动场进行彻底消毒。喂给病羊柔软、易消化、适口性好的饲料，保证充足的清洁饮水。先将病羊口唇部的痂垢剥除干净，用淡盐水或0.1％高锰酸钾水充分清洗创面，然后用紫药水或碘甘油（将碘酊和甘油按1:1比例充分混合即成)涂抹创面，每天1～2次，直至痊愈。
药物治疗。每公斤体重用病毒灵0.1克、青霉素钾或钠盐4～5毫克，每日1次，连用3日为1个疗程，间隔2～3日进行第2个疗程，一般2～3个疗程即可；维生素C0.5毫升、维生素B120.02毫升，混合肌肉注射，每日2次，3～4天为1个疗程，连用2个疗程。