在刚刚断奶时，无法保证仔猪有足够的采食量，导致仔猪饥饿。当仔猪通过饲料获取养分时，就会出现暴食现象。这个过程中的短期饥饿，会削弱胃肠道系统的消化与免疫功能。为条件性致病菌（如大肠杆菌或沙门氏菌）创造了机会，仔猪发生腹泻的机会就增加了。
某些原料（如豆粕和大多数植物蛋白饲料）含有抗营养因子（如大豆储存的蛋白甘氨酸等）可导致胃肠道炎症。当这一问题与低采食量、未消化饲料高的情况同时存在时，仔猪发生腹泻的可能就增加了。
仔猪“第一份口粮”是成功断乳的首要。次等饲料不利于仔猪早期食欲需求，因为小猪未消化物质的产生，会为胃肠道后半段的细菌增殖提供营养，从而导致仔猪腹泻的发生。
有研究表明，日粮如含有高浓度的单糖和矿物质会破坏肠上皮渗透平衡，导致肠腔分泌过多水分，形成稀便。这就是俗称的“分泌性腹泻”，它通过继发感染经常会导致非病原性并发症。
