到目前为止，仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)还没有比较有效的治疗方法，应坚持预防为主的原则，采取综合性防治措施，尽量减少损失。感染的病猪可采用抗生素治疗结合良好的饲养管理，控制并发疾病。
1、猪场内严格实行封闭式生产，执行各项相关的防疫制度，严格控制外来人员和外来车辆进入猪场，并做好灭鼠、灭蝇、灭虫工作，防止疫病传播到其他猪场。
2、改善饲养管理，猪场的饲养管理水平是决定猪呼吸道病发病率的主要因素。
3、在母猪产前4周时做好各类疫苗的免疫注射工作，使母猪处于较高的免疫状态。减少仔猪产生应激而诱发呼吸道疾病的发生，尽量减少在保育期间注射各种疫苗。
4、将保育饲料调成含一定水分的湿拌料饲喂，可相对降低发病率。
5、降低饲养密度比只用药物预防更为有效。建议保育舍应让每头仔猪有0.4平方米的生活空间，生长猪应有0.7平方米以上的生活空间，每栏猪的数量最好控制在10~12头，可相对降低猪群呼吸道疾病的发病率。当饲养密度过高时，可卖掉一些仔猪，能有效地提高饲料转化率和生长速度。
6、尽量使每天早晚的温差不要太大，断奶后2周内仔猪环境温度应为28~30℃，不合适的温度对猪呼吸道病影响较大。天气较热时，直接将断奶后的仔猪不经保育舍直接转入生长舍。
7、加强猪舍通风对流，提高舍内空气质量，保育舍猪栏之间的分隔采用封闭不透风的隔栏，限制仔猪直接接触。
8、多量避免在断奶前后3天内注射各种疫苗和进行仔猪阉割工作。
9、从分娩、保育、生长到育成，均严格采用“全进全出”的饲养方式，尽量缩小断奶日龄差异，避免把日龄相差太大的猪只混群饲养，在每批猪出栏后猪舍必须经严格冲洗消毒，空置几天后才能转入新的猪群，能对控制本病起到重要的作用。
10、保持猪群日粮合理、均衡的营养水平。经常检查或检测饲料质量，对霉菌毒素污染严重的饲料必须废弃，避免因小失大，以保证猪体免疫系统的正常运转。
11、尽量减少猪群转栏和混群的次数。转栏和混群的次数越多，呼吸道病的发病率越高；减少各种应激因素，使猪群生活在一个舒适、安静、干燥、卫生、洁净的环境。
12、仔猪应尽量减少寄养，防止疫病交叉感染，如果确实需要寄养，则必须在母猪分娩后24小时之内完成，并在10天龄以前完成仔猪阉割工作，尽量避免在断奶前后3天内注射各种疫苗，减少应激反应的发生。
